Page 39 - 《华中农业大学学报(自然科学版)》2023年第2期
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第 2 期                  刘宁宁 等:牛溶血性曼氏杆菌可视化 LAMP 检测方法的建立                                      33

               分离并保存。                                           应体系为 10× Isothermal Amlification Buffer 2.5 μL、
                   lktC 重组质粒及溶血曼氏杆菌灭活疫苗由华中                      MgSO 4 (100  mmol/L)  1.5  μL、dNTPs(10  mmol/L)
               农业大学农业微生物资源发掘与利用全国重点实                            3.5 μL、LB(10 μmol/L)1.0 μL、FIP(10 μmol/L)4.0
               验室反刍动物疾病研究室构建、制备并保存。                             μL、BIP(10 μmol/L)4.0 μL、F3(10 μmol/L)0.5 μL、
               1.2 培养基和主要试剂                                     B3(10 μmol/L)0.5 μL、Bst 2.0 DNA 聚合酶(8 000
                   本研究所使用的 LB/Amp 培养基、LB/Amp 平                  U/mL)1 μL、DNA模板1 μL以及ddH 2 O 5.5 μL。采
               板培养基和 TSB 培养基均按说明书常规配制。主要                        用控制变量法对反应条件和反应体系进行优化,温
               试剂 Bst 2.0 DNA Polymerase、MgSO 4 、dNTPs 购自       度 分 别 以 60.6、62.5、65.0、67.0、和 68.2  ℃ 进 行 反
               Bio-Rad Laboratories;Eva Green20×染料购自 Bio⁃       应;Mg  2+ 浓度分别以 0、2、4、6、8 和 10 mmol/L 进
               tium;SYBR Green I 染料、 6×Loading buffer 购自南       行反应;dNTPs 浓度分别以 0.6、0.8、1.0、1.2、1.4 和
               京诺唯赞生物有限公司。                                      1.6 mmol/L 进 行 反 应 ;环 引 物 分 别 以 0、0.2、0.4、
               1.3 引物的设计与合成                                     0.6、0.8 和 1.0 μmol/L 进行反应,反应结束后 Ct 值

                   依据溶血性曼氏杆菌 lktC 基因序列(GenBank                  越小说明反应速度越快。荧光定量 PCR 中 Ct 值最
               登录号:CP017484.1)进行引物设计。包含 2 条内引                   小的组对应的反应体系即为可视化 LAMP 的反应
               物(FIP/BIP),2 条 外 引 物(F3/B3)和 1 条 环 引 物           条件。
              (LB),引物信息如表 1 所示,引物由武汉擎科生物有                           依据荧光定量 PCR 所确立的各项体系完成反应
               限公司合成。
                                                                液的配制。随后在反应液上方滴加 30 µL 液体石蜡
                           表1 本研究中所用引物信息                        进行封闭,并在反应管管盖上滴加 0.2 µL SYBR
                        Table 1 Primers used in this study
                                                                Green Ⅰ 染料。将反应管置于 68.2 ℃恒温水浴锅中
                  引物名称 Primer name   引物序列 Primer sequence (5′-3′)
                                                                水浴 40 min,反应结束后轻甩反应管,使染料与反应
                上游内部引物              TTGTTGCAGCAGGGCAGGAGC⁃
                Forward inner primer (FIP)  GACCAGTTAGATAACCATAGCG  液充分混合,在自然光下观察颜色变化。如反应管
                下游内部引物              AACCAGAGCGGTGGCCTCTA-       中溶液由无色变为荧光绿色则判为阳性,由无色变
                Backward inner primer (BIP)  AGGTGGTGTTGTTACGACTG
                                                                为橙黄色则判为阴性。
                F3引物 Forward 3 (F3)   CAATCGCATCCGGGCTAA
                                                                    2)特异性检测。采用本文“材料与方法1.1”所述
                B3引物 Backward 3 (B3)  TCCGGTACGGTTCAGCAA
                                                                的 15 种病原进行特异性检测。提取该 15 种病原的
                环状引物
                                      CATCGTCTTCCGGCACAA
                Loop backward (LB)                              DNA 作为模板,用最终优化后的反应体系分别对这
                                                                15 种病原进行检测,根据反应管中颜色的变化判断
               1.4 阳性对照的制备
                                                                可视化 LAMP 的特异性。牛溶血性曼氏杆菌(A1、
                   1)含有 lktC基因的重组质粒的制备。在 pUC 57
                                                                A2、A6 型)菌株检测为阳性,其他病原检测为阴性即
               载 体 上 插 入 lktC 基 因(GenBank 登 录 号 :
               CP017484.1)238 bp 片段,构成 lktC 基因重组质粒。             为特异性良好。


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               将含有 lktC 质粒的菌液在 LB/Amp 液体培养基中                        3)灵敏度检测。分别以7.9×10  ~7.9×10         -1   cop⁃
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               37 ℃、180 r/min 培养 12 h,用 Omega D6943-02 质粒       ies/μL 质粒 DNA 以及 6.7×10  ~6.7×10     -4   cfu/μL
               小提试剂盒提取 DNA 作为阳性对照(提取步骤参照                        的细菌 DNA 为模板,双蒸水为阴性对照,进行基于
               试剂盒说明书),-20 ℃保存备用。                               lktC重组质粒检测的可视化 LAMP和普通 PCR的灵
                   2)溶血性曼氏杆菌 DNA 的制备。将溶血性曼                      敏度分析,根据反应管中颜色的变化判断可视化
               氏杆菌接种于 TSB 培养基中,37 ℃、180 r/min 培                 LAMP 能检测质粒和细菌 DNA 的灵敏度。检测出
               养 6 h;依照参考文献[3]所述方法,挑取单菌落置                       来的质粒拷贝数越低,或细菌菌量越低,则表明灵敏
               于 20 μL 无菌水中 ,煮沸 10 min 后冰浴 1 min,于              度越高。
               10 000 r/min 离心 2 min 后吸取上清作为阳性对照, 1.6 可视化LAMP的实用性检测
               -20 ℃保存备用。                                           对 15 只小鼠人工感染溶血性曼氏杆菌,7 d 后剖
               1.5 可视化LAMP检测方法的建立                               杀取肺脏样本,作为实用性检测的阳性样本。另 10
                   1)反应条件和反应体系的优化。本方法的初始反                       只小鼠免疫溶血性曼氏杆菌灭活疫苗。各取 5 只分
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