Page 38 - 《华中农业大学学报(自然科学版)》2023年第2期
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第42卷 第2期                          华  中   农   业  大   学  学   报                        Vol.42    No.2
               2023年    3月                   Journal  of  Huazhong  Agricultural  University   Mar. 2023,32~37

                                                                                                                                      分离并保存。                                           应体系为 10× Isothermal Amlification Buffer 2.5 μL、
               刘宁宁,易萍,郭爱珍,等.牛溶血性曼氏杆菌可视化LAMP检测方法的建立[J].华中农业大学学报,2023,42(2):32⁃37.
               DOI:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2023.02.005                                                                                     lktC 重组质粒及溶血曼氏杆菌灭活疫苗由华中                      MgSO 4 (100  mmol/L)  1.5  μL、dNTPs(10  mmol/L)
                                                                                                                                      农业大学农业微生物资源发掘与利用全国重点实                            3.5 μL、LB(10 μmol/L)1.0 μL、FIP(10 μmol/L)4.0
                         牛溶血性曼氏杆菌可视化LAMP检测方法的建立                                                                                       验室反刍动物疾病研究室构建、制备并保存。                             μL、BIP(10 μmol/L)4.0 μL、F3(10 μmol/L)0.5 μL、

                                                                                                                                      1.2 培养基和主要试剂                                     B3(10 μmol/L)0.5 μL、Bst 2.0 DNA 聚合酶(8 000
                                   刘宁宁 ,易萍 ,郭爱珍                1,2,3 ,胡长敏 ,陈颖钰          1,2                                               本研究所使用的 LB/Amp 培养基、LB/Amp 平                  U/mL)1 μL、DNA模板1 μL以及ddH 2 O 5.5 μL。采
                                                                             1
                                           1
                                                    1
                                                                                                                                      板培养基和 TSB 培养基均按说明书常规配制。主要                        用控制变量法对反应条件和反应体系进行优化,温
                            1.华中农业大学动物医学院/农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室,武汉 430070;
                                                                                                                                      试剂 Bst 2.0 DNA Polymerase、MgSO 4 、dNTPs 购自       度 分 别 以 60.6、62.5、65.0、67.0、和 68.2  ℃ 进 行 反
                            2.湖北省兽医流行病学国际科技合作基地,武汉 430070; 3.湖北洪山实验室, 武汉 430070
                                                                                                                                      Bio-Rad Laboratories;Eva Green20×染料购自 Bio⁃       应;Mg  2+ 浓度分别以 0、2、4、6、8 和 10 mmol/L 进
                       摘要  为建立一种能够快速、高效检测牛溶血性曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica)的可视化 LAMP 检测                                                 tium;SYBR Green I 染料、 6×Loading buffer 购自南       行反应;dNTPs 浓度分别以 0.6、0.8、1.0、1.2、1.4 和
                   法,利用 LAMP 引物设计软件,以溶血性曼氏杆菌保守基因 lktC 序列设计内引物、外引物及环引物,对其反应温                                                           京诺唯赞生物有限公司。                                      1.6 mmol/L 进 行 反 应 ;环 引 物 分 别 以 0、0.2、0.4、
                   度、Mg 浓度、dNTPs 浓度等条件进行优化,并检测了方法的敏感性、特异性及实用性。结果显示,该方法在                                                               1.3 引物的设计与合成                                     0.6、0.8 和 1.0 μmol/L 进行反应,反应结束后 Ct 值
                         2+
                   68.2 ℃、6 mmol/L Mg 、1.6 mmol/L dNTPs 条件下达到最佳,40 min 内完成检测并可通过肉眼判定结果,对细                                                 依据溶血性曼氏杆菌 lktC 基因序列(GenBank                  越小说明反应速度越快。荧光定量 PCR 中 Ct 值最
                                    2+
                                                                                2
                                        -1
                   菌的最低检测限为 6.7×10  cfu/μL,对 lktC 重组质粒的最低检测限为 7.9×10  copies/μL,敏感性高;与 15种病                                           登录号:CP017484.1)进行引物设计。包含 2 条内引                   小的组对应的反应体系即为可视化 LAMP 的反应
                   原均不发生交叉反应,特异性好;对背景清晰小鼠肺组织样本检测结果显示该方法实用性良好,且优于普通
                                                                                                                                      物(FIP/BIP),2 条 外 引 物(F3/B3)和 1 条 环 引 物           条件。
                   PCR方法。表明该方法可快速、高效检测牛溶血性曼氏杆菌。
                                                                                                                                      (LB),引物信息如表 1 所示,引物由武汉擎科生物有                          依据荧光定量 PCR 所确立的各项体系完成反应
                       关键词  环介导等温扩增  (LAMP); lktC基因; 溶血性曼氏杆菌; 可视化检测; 综合防控
                                                                                                                                      限公司合成。
                       中图分类号  S852.61    文献标识码  A    文章编号  1000-2421(2023)02-0032-06                                                                                                   液的配制。随后在反应液上方滴加 30 µL 液体石蜡
                                                                                                                                                  表1 本研究中所用引物信息                        进行封闭,并在反应管管盖上滴加 0.2 µL SYBR
                                                                                                                                               Table 1 Primers used in this study
                   溶血性曼氏杆菌 (Mannheimia haemolytica) 是           因,具有灵敏、便捷等优点,能够满足普通农场检测                                                                                                Green Ⅰ 染料。将反应管置于 68.2 ℃恒温水浴锅中
                                                                     [9]
               引起牛呼吸道疾病综合征的机会性病原,在运输等                           的需要 。                                                                                                                  水浴 40 min,反应结束后轻甩反应管,使染料与反应
               应激环境或其他病原混合感染情况下,可侵袭动物                               LktC(leukotoxin C)基因是由溶血性曼氏杆菌产                                                                                     液充分混合,在自然光下观察颜色变化。如反应管
               肺部引起呼吸道疾病,主要表现为呼吸困难、食欲下                          生的一种具有酰化作用的钙依赖性细胞毒素,属于                                                                                                 中溶液由无色变为荧光绿色则判为阳性,由无色变
               降、精神沉郁、发热和流鼻涕等,严重的感染 48 h 后                      重复子毒素(repeat in toxin , RTX)家族,高度保守,                                                                                   为橙黄色则判为阴性。
                   [1]
               死亡 。由该菌感染导致的疾病已在全球广泛分布, 能够作为溶血性曼氏杆菌较好的诊断靶点。因此,                                                                                                                              2)特异性检测。采用本文“材料与方法1.1”所述
               引起的死亡损失仅在北美就已超 10 亿美元 。快速                        本研究以 lktC 基因为基础,建立了一套能够用于牛                                                                                             的 15 种病原进行特异性检测。提取该 15 种病原的
                                                    [2]
               准确地对感染动物进行诊断,是采取积极和有效措                           溶血性曼氏杆菌检测的可视化 LAMP 方法,以期为                                                                                              DNA 作为模板,用最终优化后的反应体系分别对这
               施防控溶血性曼氏杆菌病的关键。                                  我 国 牛 溶 血 性 曼 氏 杆 菌 病 的 防 控 提 供 新 的 技 术                                                                                15 种病原进行检测,根据反应管中颜色的变化判断
                                                                                                                                      1.4 阳性对照的制备
                   目前,用于溶血性曼氏杆菌病诊断的方法主要                         支持。                                                                                                                    可视化 LAMP 的特异性。牛溶血性曼氏杆菌(A1、
                                                                                                                                          1)含有 lktC基因的重组质粒的制备。在 pUC 57
                                                        [6]
                            [3]
               包括普通 PCR 、多重 PCR        [4-5] 、荧光定量 PCR  和       1 材料与方法                                                               载 体 上 插 入 lktC 基 因(GenBank 登 录 号 :               A2、A6 型)菌株检测为阳性,其他病原检测为阴性即
                          [7]
               PCR-ELISA  等。但应用这些方法进行检测时需                                                                                             CP017484.1)238 bp 片段,构成 lktC 基因重组质粒。             为特异性良好。
               要昂贵的仪器设备,耗费时间长,不利于临床推广使                          1.1 供试病原和质粒                                                                                                                                          9        -1
                                                                                                                                      将含有 lktC 质粒的菌液在 LB/Amp 液体培养基中                        3)灵敏度检测。分别以7.9×10  ~7.9×10            cop⁃
               用。LAMP 方法因灵敏度高、特异性强、成本低等优                            本研究中所用到的牛溶血性曼氏杆菌(A1、A2、                                                                                                                       5         -4
                                                                                                                                      37 ℃、180 r/min 培养 12 h,用 Omega D6943-02 质粒       ies/μL 质粒 DNA 以及 6.7×10  ~6.7×10       cfu/μL
                                      [8]
               点而广泛应用于临床检测 ,但常规 LAMP 方法易                        A6型)菌株、牛多杀性巴氏杆菌(A型、B型、F型)、牛
                                                                                                                                      小提试剂盒提取 DNA 作为阳性对照(提取步骤参照                        的细菌 DNA 为模板,双蒸水为阴性对照,进行基于
               污染,荧光 LAMP 方法又费用高昂,很大程度上限制                       支原体、牛鼠伤寒沙门氏菌、牛产肠毒素型大肠杆
                                                                                                                                      试剂盒说明书),-20 ℃保存备用。                               lktC重组质粒检测的可视化 LAMP和普通 PCR的灵
               了这些方法的推广使用。                                      菌、牛副流感 3型病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛病毒
                                                                                                                                          2)溶血性曼氏杆菌 DNA 的制备。将溶血性曼                      敏度分析,根据反应管中颜色的变化判断可视化
                   环介导等温扩增 (loop-mediated isothermal am⁃        性腹泻病毒 1 型、牛轮状病毒、牛冠状病毒和牛传染
                                                                                                                                      氏杆菌接种于 TSB 培养基中,37 ℃、180 r/min 培                 LAMP 能检测质粒和细菌 DNA 的灵敏度。检测出
               plification, LAMP) 是一种类似于 PCR 的核酸扩增              性鼻气管炎病毒等均由华中农业大学农业微生物资
                                                                                                                                      养 6 h;依照参考文献[3]所述方法,挑取单菌落置                       来的质粒拷贝数越低,或细菌菌量越低,则表明灵敏
               方法,可以在恒温条件下(65 ℃左右)快速扩增靶基                        源发掘与利用全国重点实验室反刍动物疾病研究室
                                                                                                                                      于 20 μL 无菌水中 ,煮沸 10 min 后冰浴 1 min,于              度越高。
                                                                                                                                      10 000 r/min 离心 2 min 后吸取上清作为阳性对照, 1.6 可视化LAMP的实用性检测
               收稿日期: 2022 ⁃ 10 ⁃ 11
               基金项目:湖北省重点研发计划项目(2020BBA055);宁夏回族自治区重点研发计划项目(2021BEF02028);国家现代农业(肉牛/牦牛)产                                              -20 ℃保存备用。                                           对 15 只小鼠人工感染溶血性曼氏杆菌,7 d 后剖
                      业技术体系专项(CARS-37)
                                                                                                                                      1.5 可视化LAMP检测方法的建立                               杀取肺脏样本,作为实用性检测的阳性样本。另 10
               刘宁宁,E-mail:673005224@qq.com
               通信作者: 陈颖钰,E-mail:chenyingyu@mail.hzau.edu.cn                                                                               1)反应条件和反应体系的优化。本方法的初始反                       只小鼠免疫溶血性曼氏杆菌灭活疫苗。各取 5 只分
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