Page 45 - 《华中农业大学学报(自然科学版)》2023年第2期
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第 2 期 徐恩红 等:牛呼吸疾病综合征七病原联合检测多重 qPCR 方法的建立 39
有数据显示,在美国的肉牛养殖场中,70%~ 牛传染性鼻气管炎病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛副
80% 的牛发病与 BRD有关,同时 BRD致死牛占总数 流感病毒 3a 基因型、牛病毒性腹泻病毒、牛轮状病
[4]
的 40%~50%,导致美国每年损失超过 5 亿美元 。 毒、牛冠状病毒、沙门氏菌、摩氏摩根菌、大肠杆菌、
在日本,农林部 2014年报告的统计数字表明,呼吸系 昏睡嗜组织杆菌(旧称为昏睡嗜血杆菌)、不动杆菌、
[5]
统疾病占牛病的 23% 。BRD 也给我国养牛业带来 肺炎克雷伯氏菌、无乳支原体、猪链球菌、副猪嗜血
重大损失,主要发生在初生犊牛、断奶转群牛和经历 杆菌、乳房链球菌、停乳支原体、猪伪狂犬病毒等病
长途运输的新引进牛,但具体损失无准确数据。因 原体均由笔者所在实验室分离保存,使用前均经
为病因复杂,诊断、治疗和预防该病的措施有限,该 PCR和测序鉴定正确。
[6]
病尚未得到有效控制 。鉴于早期、快速和准确的诊
2)牛溶血性曼氏杆菌重组质粒。参照文献[11]
断是有效控制该病的前提,且目前已报道的检测方
制作重组质粒,其步骤简述如下:以牛溶血性曼氏杆
法存在检测病原数量少和操作复杂等问题 [7-10] ,本研 菌阳性核酸为模板,进行目的基因 PCR 扩增及产物
究针对 BRD最常见的 7种病原体包括牛支原体(My⁃ 纯化回收,回收产物与 pMD19-T 载体连接,转化至
coplasma bovis,M.b)、多杀性巴氏杆菌(Pasteurella DH5α 感受态细胞培养,通过蓝白斑筛选,挑取单克
multocida,P.m)、牛溶血性曼氏杆菌(Mannheimia
隆白色菌落进行 PCR 鉴定,检测阳性的菌落送北京
haemolytica,M.h)、牛传染性鼻气管炎病毒(infec⁃
擎科生物公司测序。通过序列比对,测序结果与克
tious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)、牛呼吸道合
隆 基 因 目 的 片 段 完 全 一 致 的 阳 性 克 隆 接 种 至
胞体病毒(bovine respiratory syncytial virus,BRSV)、
Amp*LB 液体培养基,提取质粒。根据计算公式:质
牛副流感病毒 3 型 a 基因型(bovine parainfluenza vi⁃
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粒拷贝数=[6.02×10 ×质粒质量浓度(ng/μL)×
rus type 3a,BPIV-3a)和 c 基因型(BPIV-3c),建立一
10 ]/(质粒碱基数×660),进行质粒拷贝数浓度
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种能够同时检测以上 7 种病原的荧光定量 PCR 检测
方法,以期为临床诊断 BRD 提供一种敏感、特异、多 换算,-20 ℃保存备用,作为荧光定量 PCR 的标
联、快速的病原学检测方法,为早期确诊 BRD,实施 准品。
精准治疗和防控方案、提高养殖效益,以及有效开展 牛支原体、多杀性巴氏杆菌、牛传染性鼻气管炎
BRD病原学和流行病学监测研究等提供理论依据。 病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛副流感病毒 3a和 3c基
因型的重组质粒均由北京擎科生物技术有限公司构
1 材料与方法
建合成并完成鉴定(表1)。
1.1 病原体、质粒及临床样品 3)临床样品。115 份牛鼻拭子均采集自 2021-
1)病原体。牛支原体、多杀性巴氏杆菌(A 型、B 2022 年间,华中地区不同牛场发生牛呼吸道疾病的
型、D 型、F 型)、牛溶血性曼氏杆菌(A1 型和 A6 型)、 病牛。经常规PCR检测,58份样品为病原阳性。
表1 BRD 7种病原重组质粒信息
Table 1 Recombinant plasmids of seven BRD pathogens
病原 基因登录号 靶基因 载体 插入片段大小(bp)及在靶基因中位置(nt)
Pathogens Accession number Target genes Vectors Insert fragment size and position
M.b CP042939.1 OPPD\F pMD18T 191(66~256)
P.m CP033600.1 ompH pMD18T 183(329~511)
M.h CP017484.1 GCP pMD18T 171(247~417)
IBRV MG407785.1 gB pMD18T 118(1 486~1 603)
BRSV AF054664.1 N pMD18T 149(585~733)
BPIV-3a MH552577.1 N pMD18T 153(1 322~1 474)
BPIV-3c LC040886.1 N pUC57 1548(1~1 548)
1.2 主要试剂 术(北京)有限公司(TaKaRa 中国)产品;HiScript Q
核酸染料 Gel-red、50 bp DNA Ladder、DL 2000 Select RT SuperMix for qPCR 反转录试剂盒、Virus
DNA Marker、2×Taq Master Mix、2×T5 Fast qP⁃ DNA/RNA Extraction Kit 2.0(Prepackaged)核酸提
CR Mix(Probe)为北京擎科生物技术有限公司产品; 取试剂盒为南京诺唯赞生物科技股份有限公司产
PrimeSTAR Max DNA Polymerase 为宝日医生物技 品,质粒小提试剂盒为 OMEGA 公司产品,凝胶回收

