Page 45 - 《华中农业大学学报(自然科学版)》2023年第2期
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第 2 期               徐恩红 等:牛呼吸疾病综合征七病原联合检测多重 qPCR 方法的建立                                     39

                   有数据显示,在美国的肉牛养殖场中,70%~                        牛传染性鼻气管炎病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛副
               80% 的牛发病与 BRD有关,同时 BRD致死牛占总数                     流感病毒 3a 基因型、牛病毒性腹泻病毒、牛轮状病
                                                          [4]
               的 40%~50%,导致美国每年损失超过 5 亿美元 。 毒、牛冠状病毒、沙门氏菌、摩氏摩根菌、大肠杆菌、
               在日本,农林部 2014年报告的统计数字表明,呼吸系                       昏睡嗜组织杆菌(旧称为昏睡嗜血杆菌)、不动杆菌、
                                 [5]
               统疾病占牛病的 23% 。BRD 也给我国养牛业带来                       肺炎克雷伯氏菌、无乳支原体、猪链球菌、副猪嗜血
               重大损失,主要发生在初生犊牛、断奶转群牛和经历                          杆菌、乳房链球菌、停乳支原体、猪伪狂犬病毒等病
               长途运输的新引进牛,但具体损失无准确数据。因                           原体均由笔者所在实验室分离保存,使用前均经
               为病因复杂,诊断、治疗和预防该病的措施有限,该                          PCR和测序鉴定正确。
                                 [6]
               病尚未得到有效控制 。鉴于早期、快速和准确的诊
                                                                    2)牛溶血性曼氏杆菌重组质粒。参照文献[11]
               断是有效控制该病的前提,且目前已报道的检测方
                                                                制作重组质粒,其步骤简述如下:以牛溶血性曼氏杆
               法存在检测病原数量少和操作复杂等问题                   [7-10] ,本研  菌阳性核酸为模板,进行目的基因 PCR 扩增及产物
               究针对 BRD最常见的 7种病原体包括牛支原体(My⁃                      纯化回收,回收产物与 pMD19-T 载体连接,转化至
               coplasma bovis,M.b)、多杀性巴氏杆菌(Pasteurella          DH5α 感受态细胞培养,通过蓝白斑筛选,挑取单克
               multocida,P.m)、牛溶血性曼氏杆菌(Mannheimia
                                                                隆白色菌落进行 PCR 鉴定,检测阳性的菌落送北京
               haemolytica,M.h)、牛传染性鼻气管炎病毒(infec⁃
                                                                擎科生物公司测序。通过序列比对,测序结果与克
               tious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)、牛呼吸道合
                                                                隆 基 因 目 的 片 段 完 全 一 致 的 阳 性 克 隆 接 种 至
               胞体病毒(bovine respiratory syncytial virus,BRSV)、
                                                                Amp*LB 液体培养基,提取质粒。根据计算公式:质
               牛副流感病毒 3 型 a 基因型(bovine parainfluenza vi⁃
                                                                                   23
                                                                粒拷贝数=[6.02×10 ×质粒质量浓度(ng/μL)×
               rus type 3a,BPIV-3a)和 c 基因型(BPIV-3c),建立一
                                                                10 ]/(质粒碱基数×660),进行质粒拷贝数浓度
                                                                  -9
               种能够同时检测以上 7 种病原的荧光定量 PCR 检测
               方法,以期为临床诊断 BRD 提供一种敏感、特异、多                       换算,-20 ℃保存备用,作为荧光定量 PCR 的标
               联、快速的病原学检测方法,为早期确诊 BRD,实施                        准品。
               精准治疗和防控方案、提高养殖效益,以及有效开展                              牛支原体、多杀性巴氏杆菌、牛传染性鼻气管炎
               BRD病原学和流行病学监测研究等提供理论依据。                          病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛副流感病毒 3a和 3c基
                                                                因型的重组质粒均由北京擎科生物技术有限公司构
               1 材料与方法
                                                                建合成并完成鉴定(表1)。
               1.1 病原体、质粒及临床样品                                      3)临床样品。115 份牛鼻拭子均采集自 2021-

                   1)病原体。牛支原体、多杀性巴氏杆菌(A 型、B                     2022 年间,华中地区不同牛场发生牛呼吸道疾病的
               型、D 型、F 型)、牛溶血性曼氏杆菌(A1 型和 A6 型)、 病牛。经常规PCR检测,58份样品为病原阳性。
                                                 表1 BRD 7种病原重组质粒信息
                                        Table 1 Recombinant plasmids of seven BRD pathogens
                     病原            基因登录号                靶基因            载体       插入片段大小(bp)及在靶基因中位置(nt)
                   Pathogens      Accession number    Target genes    Vectors      Insert fragment size and position
                    M.b            CP042939.1          OPPD\F        pMD18T              191(66~256)
                    P.m            CP033600.1           ompH         pMD18T             183(329~511)
                    M.h            CP017484.1            GCP         pMD18T             171(247~417)
                    IBRV           MG407785.1            gB          pMD18T            118(1 486~1 603)
                    BRSV           AF054664.1             N          pMD18T             149(585~733)
                    BPIV-3a        MH552577.1             N          pMD18T            153(1 322~1 474)
                    BPIV-3c        LC040886.1             N           pUC57             1548(1~1 548)
               1.2 主要试剂                                         术(北京)有限公司(TaKaRa 中国)产品;HiScript Q

                   核酸染料 Gel-red、50 bp DNA Ladder、DL 2000        Select RT SuperMix for qPCR 反转录试剂盒、Virus
               DNA  Marker、2×Taq  Master  Mix、2×T5  Fast  qP⁃   DNA/RNA Extraction Kit 2.0(Prepackaged)核酸提
               CR Mix(Probe)为北京擎科生物技术有限公司产品; 取试剂盒为南京诺唯赞生物科技股份有限公司产
               PrimeSTAR Max DNA Polymerase 为宝日医生物技             品,质粒小提试剂盒为 OMEGA 公司产品,凝胶回收
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