Page 40 - 《华中农业大学学报》2020年第6期

华 中 农 业 大 学 学 报 第 ３９ 卷
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在 XCCN１４ 中, 蛋白 ID 为 WP _ ０１１０３６３４２．１ 、
WP _ ０１１０３７１１８．１ 、 WP _ ０１１０３７１９７．１ 、 WP _
０１１０３９０２０．１ 、 WP _ ０１２４３７８２５．１ 、 WP _ ０１４５０８９８８．１ 、
WP _ ０１４５０９５４６．１ 、 WP _ ０１９２３７２２５．１ 、 WP _

０４０９４０９０１．１ 、 WP _ ０４０９４１８１６．１ 、 WP _ ０４０９４２３５７．１
和 WP _ ０５２８４４７０８．１ 共 １２ 个蛋白具有明显的保守
结构域, 占总数的 ８．８９％ ;同时, ２２ 个蛋白具有跨
膜结 构 域, 其 ID 分 别 为 WP _ ０１１０３６６８７．１ 、 WP _
０１１０３８８７９．１ 、 WP _ ０１１０３９０１６．１ 、 WP _ ０１１２７００５９．１ 、
WP _ ０１２４３７３９８．１ 、 WP _ ０１２４３７４５０．１ 、 WP _

０１２４３７９５２．１ 、 WP _ ０１２４３７９９２．１ 、 WP _ ０１２４３８６９５．１ 、 图 ５ 黄单胞菌分泌蛋白含有潜在转运肽
WP _ ０１４５０６１００．１ 、 WP _ ０４０９４０３５３．１ 、 WP _ 的预测可靠性分析
０４０９４０５３２．１ 、 WP _ ０４０９４０５４０．１ 、 WP _ ０４０９４０５５１．１ 、 Fi g ．５ Predictivereliabilit yofsomesecretar y
p roteininX．cam p estris
WP _ ０４０９４０５５７．１ 、 WP _ ０４０９４０７０５．１ 、 WP _
研究 提 供 了 重 要 的 数 据 支 撑. 国 内 外 学 者 对 真
０４０９４０８０５．１ 、 WP _ ０４０９４１２４６．１ 、 WP _ ０４０９４１５５４．１ 、
菌 [ １８ ] 、 卵菌 [ １９ ] 及枯草芽孢杆菌、 细菌性黑斑病菌 [ １１ ]
WP _ ０４３８７７９１５．１ 、 WP _ ０７６０５４７３７．１ 、 WP _
等病原菌分泌蛋白进行了大量的生物信息学分析,
１０８１３３９３３．１ , 占总数的 １６．３０％ ( 图 ４C ).
2.4 分泌蛋白转运肽分析 但尚缺乏对于植物病原菌中分泌蛋白理化性质及特
黄单 胞 杆 菌 XCB１００ 、 XC８００４ 、 XCCN１４ 中 分 征分析工作的研究.分泌蛋白的理化性质及特征关
别有 １３５ 、 １２８ 、 １３５ 个分泌蛋白定位于 S ( 信号肽): 系着其功能的发挥, 前人研究表明, 病原菌在侵染植
在 XCB１００ 中, 有 ３２ 个蛋白预测概率大于 ０．８ , 约占 物的过程中分泌蛋白发挥着极其重要的作用, 即植
总数 的 ２３．７０％ ; 有 ３６ 个 分 泌 蛋 白 所 处 的 概 率 在 物病原真菌、 卵菌以及细菌等不同物种之间, 甚至在
０．６~０．８ , 约占总数的 ２６．６７％ ; 有 ４０ 个分泌蛋白所 同一群体不同物种之间, 以及同一物种不同种之间,
处的预测概率在 ０．４~０．６ , 约占总数的 ２９．６３％ ; 有 所含有的分泌蛋白比例较为近似, 这为未来学术界
２７ 个分泌蛋白所处的预测概率在 ０．２~０．４ , 约占总 进一步开展不同物种、 不同群体以及同一物种不同
数的 ２０．００％ .在 XC８００４ 中, 有 ２９ 个预测概率大 种之间分泌蛋白的功能共性化和差异化研究提供了
于 ０．８ , 约占总数的 ２２．６６％ ; 有 ３９ 个分泌蛋白所处 重要的参考.
的概率在 ０．６~０．８ , 约占总数的 ３０．４７％ ; 有 ３８ 个分 本研究采用生物信息学分析软件对 ３ 个黄单胞
泌蛋白所处 的 预 测 概 率 在 ０．４~０．６ , 约 占 总 数 的 菌 XCB１００ 、 XCCN１４ 和 XC８００４ 菌株中的分泌蛋白

２９．６９％ ; 有 ２２ 个分泌蛋白所处的预测概率在 ０．２~ 理化性质及特征进行了分析, ３ 种黄单胞菌中具有
０．４ , 约占总数的 １７．１９％ .在 XCCN１４ 中, 有 ２８ 个 典型特 征 的 分 泌 蛋 白 分 别 为 １３５ 、 １３５ 、 １２８ , 利 用
分泌蛋白的预测概率大于０．８ , 约占总数的２０．７４％ ; Protscale 、 SMART 、 Tar g etP２．０Server等生物信息
有３８ 个分泌蛋白所处的概率在 ０．６~０．８ , 约占总数 学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、 保守结
的 ２８．１４％ ; 有 ４３ 个 分 泌 蛋 白 所 处 的 预 测 概 率 在 构域以及转运肽等分析, 初步明确了黄单胞菌分泌
０．４~０．６ , 约占总数的 ３１．８５％ ; 有 ２２ 个分泌蛋白所 蛋白的理化性质及其特征.结果表明, ３ 种黄单胞
菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关
处的预 测 概 率 在 ０．２~０．４ , 约 占 总 数 的 １９．２６％
( 图 ５ ). 关系, 以碱性蛋白质、 稳定蛋白质、 亲水性蛋白质居
3 讨 论 多, 平均 ４４．７３％ 的蛋白为不稳定蛋白, 平均 ８３．２１％
的蛋白总平均亲水性小于 ０ , 属于亲水性蛋白, 亲水
近年来, 关于植物病原菌分泌蛋白和碳水化合 性最强氨基酸残基以 D 和 R 居多, 而疏水性最强氨
物活性酶、 效应分子等的研究已经成为植物病理学 基酸残基以 A 和 L 居多.同时, 每个黄单胞菌的分
研究的重点和难点 [ １０ ] .植物病原菌全基因组序列 泌蛋白中平均有 １２ 个具有明显的保守结构域, 并且
的 公布, 为学术界深入开展上述病原菌致病基因的 所有分泌蛋白具有信号肽, 转运肽预测可能性分布