Page 36 - 《华中农业大学学报》2020年第6期
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第 ３９ 卷 第 ６ 期                     华   中   农   业   大   学   学   报                      Vol．３９ No．６
               ２０２０ 年  １１ 月                 JournalofHuazhon gA g riculturalUniversit y        Nov．２０２０ , ３０~３６


               覃悦, 祝友朋, 韩长志 ． 黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析[ J ] ． 华中农业大学学报, ２０２０ , ３９ ( ６ ): ３０Ｇ３６．
               DOI : １０．１３３００ / j ．cnki．hnlkxb．２０２０．０６．００５

                              黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析


                                                  覃悦, 祝友朋, 韩长志



                            西南林业大学生物多样性保护学院 / 云南省森林灾害预警与控制重点实验室, 昆明 ６５０２２４

                       摘要   基于全基 因 组 序 列 已 经 公 布 的 黄 单 胞 菌 Xanthomonascam p estris B１００ 、 Xanthomonascam p estris
                   p v．cam p estris８００４ 、 Xanthomonascam p estrisCN１４ 中分泌蛋白序列为基础数据, 采用 Protscale 、 SMART 、 TarＧ
                   g etP２．０Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、 保守结构域以及转运肽等分析, 结果显
                   示: 黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系, ４４．７３％ 的蛋白为不稳定蛋白, ８３．２１％ 的蛋
                   白亲水性小于 ０ , 属于亲水性蛋白.同时, 在每种黄单胞菌的分泌蛋白中, 具有明显保守结构域的蛋白数量平均
                   为 １２ 个, 并且所有分泌蛋白均具有信号肽, 转运肽预测可能性分布也较为平均.
                       关键词   黄单胞菌;分泌蛋白;理化性质;生物信息学分析;植物病原菌;亚细胞定位;转运肽
                       中图分类号  S４３５．１   文献标识码  A   文章编号  １０００Ｇ２４２１ ( ２０２０ ) ０６Ｇ００３０Ｇ０７

                  黄单胞菌( Xanthomonascam p estris ) 在分类上         展了大量研究, 笔者所在研究室前期已完成对黄单
               归属于薄壁菌门( Gracilicutes ) 暗细菌纲( ScotobacＧ 胞菌 X．cam p estrisB１００ 、 X．cam p estrisCN１４ 、 X．
               teria ) 假单胞菌科( Pseudomonadaceae ) 黄单胞菌属 cam p estrisp v．cam p estris８００４ ( 上述菌株登录号分
               ( Xanthomonas ) .前人研究发现, 该菌是专性好                 别为 GCA _ ００００７０６０５．１ 、 GCA _ ０００４０１７３５．２ 、 GCA _
                              [ １ ]
               氧、 化能有机营养型革兰氏阴性植物病原细菌, 能引 ００００１２１０５．１ , 以 下 分 别 简 称 为 XCB１００ 、 XC８００４ 、
               起十字花科蔬菜及芒果、 核桃等多种重要农林经济                         XCCN１４ ) 等黄 单 胞 菌 中 分 泌 蛋 白 的 预 测 工 作, 然
               植物病害, 给生产上造成巨大的经济损失, 严重影响                       而, 尚不清楚其理化性质、 保守结构域以及亚细胞定
               着上述农林产业的健康发展.近年对该菌的研究主                          位情况, 制约着对该病菌分泌蛋白功能的进一步研
               要集中于致病基因功能           [ ２ ] 、 Har p inX 耐热机制 [ ３ ] 、 转  究.本 研 究 基 于 前 期 研 究 结 果, 利 用 Protscale 、
               录调节因子      [ ４ ] 、 效应蛋白  [ ６ ] 、 该菌与黄原胶的作用关 SMART 、 Tar g etP２．０Server等生物信息学分析软
               系  [ ７ ] 以及分类研究  [ ８ ] 等方面.                     件对上述分泌蛋白展开理化性质、 保守结构域以及
                   植物作为生物界的重要生产者之一, 在其生长                       转运肽等 分 析, 以 期 为 深 入 开 展 对 分 泌 蛋 白 在 黄
               发育的全过程中始终受到来自于真菌、 细菌和卵菌                         单胞菌侵 入 寄 主 植 物 过 程 中 功 能 解 析 奠 定 基 础,
               等微生物的侵染        [ ９ ] .特别是近年随着对上述微生物             也为后续开展生物学实验提供重要的理论支撑.
               分泌蛋白、 CAZ y mes蛋白研究的不断深入              [ １０ ] , 证实
                                                               1 材料与方法
               病原细菌与植物相互作用过程中, 病原细菌通过分
               泌系统将分泌蛋白输入到寄主组织中, 以更好地侵                         1.1  分泌蛋白序列来源
               染植物, 这些分泌蛋白还可作为效应分子与植物中                              前期笔者所在研究室根据分泌蛋白所具有的典
               的防卫反应相关分子发生作用, 从而在植物中实现                         型特征, 从信号肽、 亚细胞定位以及跨膜结构等方面
               定殖、 扩 展 等   [ １１ ] . 前 人 已 对 稻 瘟 菌 [ １２ ] 、 致 病 疫 霉  入手, 利用诸多生物信息学分析软件, 确定黄单胞菌
               菌  [ １３ ] 和大丽轮枝菌  [ １４ ] 等植物病原真菌分泌蛋白开           XCB１００ 、 XCCN１４ 和 XC８００４ 中具有典型特征的分


               收稿日期: ２０２０Ｇ０６Ｇ１５
               基金项目:国家 自 然 科 学 基 金 项 目 ( ３１９６０３１４ ); 云 南 省 应 用 基 础 研 究 计 划 项 目 ( ２０１８FG００１Ｇ０２８ ); 云 南 省 研 发 经 费 投 入 补 助 项 目
                       ( ２０１６YB４６２&２０１７YB２３６ )
               覃悦, 硕士研究生 ． 研究方向: 资源利用与植物保护 ．EＧmail : ４５３２７６４０３＠ qq ．com
               通信作者:韩长志, 博士, 副教授 ． 研究方向:经济林木病害生物防治与真菌分子生物学 ．EＧmail : hanchan g zhi２０１０＠１６３．com
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