Page 38 - 《华中农业大学学报》2020年第6期

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华 中 农 业 大 学 学 报 第 ３９ 卷
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2.2 分泌蛋白不稳定系数及亲水性分析 言, XCB１００ 、 XC８００４ 、 XCCN１４ 的分泌 蛋白中分别
就 所 预 测 的 不 稳 定 系 数 而 言,黄 单 胞 菌 有 １１２ 、 １１１ 以及 １１２ 个蛋白总平均亲水性小于 ０ ,
XCB１００ 、 XC８００４ 、 XCCN１４ 的 分 泌 蛋 白 中 分 别 有 属于亲水性蛋白, 所占比例分别为 ８２．９６％ 、 ８６．７２％
６１ 、 ５８ 以及 ５９ 个蛋白的不稳定性系数大于 ４０ , 属于 和 ８２．９６％ , 其余总平均亲水性均大于 ０ , 属于疏水
不稳定 蛋 白, 所 占 比 例 分 别 为 ４５．１９％ 、 ４５．３２％ 、 性 蛋 白, 所 占 比 例 分 别 为 １７．０４％ 、 １３．２８％ 和
４３．７０％ , 其他均为稳定蛋白( 图 ２A ).就疏水性而 １７．０４％ ( 图 ２B ).

图 ２ 黄单胞菌中分泌蛋白不稳定性系数( A ) 及总平均亲水性( B ) 分布情况
Fi g ．２ Instabilit y coefficientandtotalavera g eh y dro p hilicit ydistributionofsecretar yp roteinsinX．cam p estris
同 时, 对 ３ 种 黄 单 胞 菌 中 分 泌 蛋 白 的 最 强 亲 WP _ ０１２４３８４１３．１ 、 WP _ ０１２４３９２５８．１ 、 WP _ ０１２４３９６５６．１ 、
( 疏) 水性氨基酸残基基本情况进行统计分析, 结果 WP _ ０１４５０８９８８．１ 、 WP _ ０１６９４４９６０．１和 WP _ ０４０９４２３５７．１
显示, 在 XCB１００ 中, 尤 以 ID 为 WP _ ０１２４３７４６４．１ 共１３个蛋白具有明显的保守结构域, 占总数的 ９．６３％ ,
的分泌蛋白中位于 １７７ 、 １７８ 位的 D ( 天冬氨酸) 和 Q 同时, 蛋白ID 为 WP _ ０１１０３７９２６．１ 、 WP _ ０１１０３８８７９．１ 、
( 谷氨酰胺) 亲水性最高, 数值为 －３．８７８ , 而 ID 为 WP _ ０１１０３９０１６．１ 、 WP _ ０１１２７００５９．１ 、 WP _ ０１２４３７０１４．１ 、
WP _ ０１２４３７１０４．１ 的分泌蛋白中位于 １２１ 位的 L ( 亮 WP _ ０１２４３７２４７．１ 、 WP _ ０１２４３７２５８．１ 、 WP _ ０１２４３７３９８．１ 、
氨酸) 疏水性最高, 数值为 ４．０５６ ; 在 XC８００４ 中, 尤 WP _ ０１２４３７４４９．１ 、 WP _ ０１２４３７４５０．１ 、 WP _ ０１２４３７６１２．１ 、
以ID 为 WP _ ０１１０３５９２９．１ 位于 ６８ 、 ６９ 位的 R ( 精氨 WP _ ０１２４３７９５２．１ 、 WP _ ０１２４３７９９２．１ 、 WP _ ０１２４３８２０３．１ 、

酸) 和 D 亲水性最高, 数值为 －４．１６７ , 而ID 为 WP _ WP _ ０１２４３８６９５．１ 、 WP _ ０１２４３８７１７．１ 、 WP _ ０１２４３８８１３．１ 、
０１１０３７１１８．１ 位于７ 位的 V ( 缬氨酸) 疏水性最高, 数 WP _ ０１２４３９１６３．１和 WP _ ０１２４３９６０７．１ 共１９个蛋白具有

值 为 ３．９６７ ; 在 XCCN１４ 中,尤 以 ID 为 WP _ 跨膜结构域, 占总数的１４．０７％ ( 图４A ).
０１２４３８６９５．１ 位于１２３ 位的 A ( 丙氨酸) 亲水性最高, 在 XC８００４ 中, 蛋 白 ID 为 WP _ ０１１０３５８８６．１ 、
数值为 －３．６５６ , 而 ID 为 WP _ ０１１０３７１１８．１ 位于 ７ WP _ ０１１０３５８８７．１ 、 WP _ ０１１０３６３４２．１ 、 WP _
位的 V 疏水性最高, 数值为 ３．９６７ ( 图 ３A ).进一步 ０１１０３７１１８．１ 、 WP _ ０１１０３７１９７．１ 、 WP _ ０１１０３７５２５．１ 、
对每个分泌蛋白的最强亲( 疏) 水 性 氨 基 酸 残 基 进 WP _ ０１１０３７９７４．１ 、 WP _ ０１１０３８５３５．１ 、 WP _
行 统 计 分 析, 结 果 显 示: 最 强 亲 水 性 氨 基 酸 残 基 ０１１０３８６２９．１ 、 WP _ ０１１０３９０２０．１ 和 WP _
为 D 和 R 的 分 泌 蛋 白 数 量 最 多, 平 均 分 别 为 ２３ ０１１０３９１８７．１ 共 １１ 个蛋白具有明显的保守结构域,
和 １８ 个, 而 最 强 疏 水 性 氨 基 酸 残 基 为 A 和 L 的 占总数的 ８．５９％ , 同时, １５ 个蛋白具有跨膜结构域,
分 泌 蛋 白 量 最 多,平 均 分 别 为 ３７ 和 ４７ 个 其ID 分别为 WP _ ０１１０３５７１４．１ 、 WP _ ０１１０３５９２９．１ 、
( 图 ３B 、 C ). WP _ ０１１０３６６８７．１ 、 WP _ ０１１０３６７０７．１ 、 WP _
2.3 分泌蛋白保守结构域分析 ０１１０３７３４２．１ 、 WP _ ０１１０３７６１７．１ 、 WP _ ０１１０３７６２３．１ 、
对黄单胞菌中分泌蛋白开展保守结构域分析, 结 WP _ ０１１０３８２０５．１ 、 WP _ ０１１０３８７０８．１ 、 WP _
果显示: 在 XCB１００ 中, 蛋白 ID 为 WP _ ０１１０３５８８６．１ 、 ０１１０３８８７９．１ 、 WP _ ０１１０３９０１６．１ 、 WP _ ０１１２６９４９１．１ 、
WP _ ０１１０３７１１８．１ 、 WP _ ０１１０３７９７４．１ 、 WP _ ０１１０３８６２９．１ 、 WP _ ０１１２６９５３４．１ 、 WP _ ０１１２７００５９．１ 、 WP _
WP _ ０１１０３９０２０．１ 、 WP _ ０１２４３６９９３．１ 、 WP _ ０１２４３８０７３．１ 、 ０１１２７００８４．１ , 占总数的 １１．７２％ ( 图 ４B ).