Page 49 - 《华农农业大学学报》2020年第2期

第 ２ 期 陈一铭 等:白斑综合征病毒感染对克氏原螯虾肠道菌群的影响 ４ ３

g obacterium ), 这些结果说明 WSSV 感染使克氏原
螯虾肠道菌群结构发生改变.
表 ２ 对照组和感染组门水平上细菌丰度
Table２ Bacterialabundanceat p h y lalevelin
control g rou pandWSSVinfectedg rou p
丰度 / ％ Abundance
分类 Taxonom y
对照 Control WSSV
变形菌门 Proteobacteria ７５．４２ ７８．１４
软壁菌门 Tenericute １９．１７ ０．８４
拟杆菌门 Bacteroidetes ０．６３ １７．３８
厚壁菌门 Firmicutes ４．２４ ３．１１
放线菌门 Actinobacteria ０．３６ ０．２２
图 ４ 对照组和 WSSV 感染组肠道
梭杆菌门 Fusobacteria ０．０４ ０．０１
微生物在属水平的相对丰度
Fi g ．４ Relativeabundanceoftheg enuslevelin
酸杆菌门 Acidobacteria ０．０２ ０．０４
其他 Others ０．１２ ０．２６ control g rou pandWSSVinfectedg rou p

∗ 表示显著性水平 P＜０．０５ , n．s． 表示差异不显著. ∗indicateP＜０．０５ , n．s．notsi g nificant．
图 ５ ２ 组中部分菌属相对丰度对比
Fi g ．５ Com p arisonofrelativeabundanceofsomes p eciesincontrol g rou pandWSSVinfectedg rou p
2.4 LEfSe 分析 3 讨 论
为进一步分析与 WSSV 感染相关的克氏原螯
本研究通过人工感染人为增加克氏原螯虾体内
虾肠道菌群, 用 LEfSe分析法对对照组和 WSSV 人
工感染组肠道菌群相对丰度进行比较分析, 以找出 WSSV 的病毒载量, 模拟养殖过程克氏原螯虾白斑
显著性变化的相关菌群.如图 ６A 所示, 经过线性 病发病历程, 评价 WSSV 感染对肠道菌群的影响,
判别分析( LDA ), 发现对照组与 WSSV 感染组的菌 发现 WSSV 感染导致克氏原螯虾肠道菌群结构发
群共有 ３ 个具有显著差异的菌群, 隶属于 ２ 个菌门. 生改变.尽管试验用虾人工感染前检测 出少量的
其中对照组只有１ 个菌属( Candidatusbacillo p lasＧ WSSV 基因组 DNA , 但并未呈现明显临床病症, 仅
ma ), 隶属于软壁菌门, 且具有较大丰度.感染组的 为携带状态.流行病学调查显示, 养殖小龙虾携带
２个菌群隶属于拟杆菌门的拟杆菌科( BacteroidaceＧ WSSV 较为普遍 [ １３ ] .笔者所在实验室研究人员先
ae ) 和黄杆菌科( Flavobacteria ), 它们的亲缘关系如 前针对克氏原螯虾白斑综合征的流行病学调查也表
图 ６B 所示. 明 WSSV 拷贝数在 １０ 以下时养殖克氏原螯虾不会
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