Page 48 - 《华农农业大学学报》2020年第2期
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华 中 农 业 大 学 学 报 第 ３９ 卷
表 １ 对照组和感染组 αＧ 多样性指数
Table１ αＧDiversit y ofcontrol g rou pandWSSVinfectedg rou p
样品 序列数 分类操作单元 丰富度指数 Richnessindex 覆盖率 多样性指数 Diversit y index
Sam p leID Reads OTU ACE Chao１ Covera g e Shannon Sim p son
CK
c１ ６３１５９ １９５ １６２．７６１ １８３．５２２ ０．９９８ ３．１２４ ０．８０１
c２ ６０４２２ ２２０ １９７．２８ ２３９．５１７ ０．９９８ １．８０４ ０．４３８
c３ ８０１６２ １９０ １６１．２５１ １７９．８３７ ０．９９８ ２．５５３ ０．６７７
c４ ７７３１６ １５４ １２０．５５４ １３７．４４ ０．９９８ １．４７５ ０．４２３
c５ ８０２０８ １７０ １２５．８９２ １６３．２８５ ０．９９９ ２．０５５ ０．５７７
均值 Mean １５３．５０±２７．９０ １８０．７２±３３．５９ ０．９９８２±０．０００４ ２．２０±０．５７ ０．５８±０．１４
WSSV
w１ ５２４６４ ２０９ １７９．１２５ １９０．３８５ ０．９９９ １．９０２ ０．５７
w２ ６７８０２ ２１７ １９６．０７６ ２３５．４８７ ０．９９８ ３．０１３ ０．８０６
w３ ５０３２３ ２１７ １７９．２６７ １８８．７３３ ０．９９８ ４．０１７３ ０．８９９
w４ ８００４３ ３３７ ２８０．０９７ ３４７．０１２３ ０．９９９ １．９１９ ０．５８７
w５ ５２６２０ １４５ １２１．６９ １４１．３０７ ０．９９８ １．８０８ ０．４５８
均值 Mean １９１．２５±５１．０８ ２２０．５８±６９．８８ ０．９９８４±０．０００４ ２．５３±０．８６ ０．６６±０．１６
注: c１~c５ 代表对照组样品编号, w１~w５ 代表 WSSV 感染组样品编号. Note : c１Ｇc５re p resentthesam p lenumberofcontrol g rou p , w１Ｇ
w５re p resentthesam p lenumberofWSSVinfectiong rou p ．
多样性指数感染组均略高于对照组, 但没有显著性 nobacteria )、 梭 杆 菌 门 ( Fusobacteria )、 酸 杆 菌 门
差异( 表 １ ). Beta多样性分析显示感染组和对照组 ( Acidobacteria )、 疣微菌门( Verrucomicrobia )、 蓝藻
无显著性差异( 数据略).这些结果说明 WSSV 感染 门( C y anobacteria ) 和 奇 古 菌 门 ( Thaumarchaeota )
对克氏原螯虾肠道菌群丰度和多样性几乎没有影响. 等.选取每个样本或分组在门类水平上最大 丰度
2.3 肠道菌群结构 排名前 １０ 的 物 种, 生 成 物 种 相 对 丰 度 柱 形 累 加
在对照组与 WSSV 感染组的克氏原螯虾肠道 图, 如图 ３ 所 示.结 果 显 示 对 照 组 优 势 菌 门 为 变
菌群共发现 １７ 个门类, 包括变形菌门( ProteobacteＧ 形菌门( 占 ７５．４２％ ) 和 软 壁 菌 门( 占 １９．１７％ ), 感
ria )、 软 壁 菌 门 ( Tenericute )、 拟 杆 菌 门 ( BacteＧ 染组肠道优 势 菌 门 为 变 形 菌 门 ( 占 ７８．１４％ ) 和 拟
roidetes )、 厚壁菌门( Firmicutes )、放线菌门( ActiＧ 杆菌门( 占 １７．３８％ .)
图 ３ 对照组和感染组肠道微生物在门水平的相对丰度
Fi g ．３ Relativeabundanceofthep h y lalevelincontrol g rou pandWSSVinfectedg rou p
在属的水平上, 共检测到 ２０７ 个细菌种属, 其中 ( Bacteroides ) 占 ２．７８％ ( 图 ４ ).虽然正常和患病的
对照组的克氏原螯虾肠道优势菌为寡养 单胞菌属 虾肠道优势菌属均为寡养单胞菌, 但患病虾肠道中
( Stenotro p homonas ) 占 ５３．０１％ 、 希瓦氏菌属( SheＧ 拟杆菌属丰度显著上升, 希瓦氏菌属及 Candidatus
wanella ) 占 １９．５７％ 、 Candidatusbacillo p lasma 占 bacillo p lasma 显著降低.如图 ５ 所示, ２ 组中其他
１８．５２％ . WSSV 感染组虾肠道优势菌属为寡养单 差异显著的细菌分别有气单胞菌属( Aeromonas )、
胞菌属占 ６３．２３％ 、 希瓦氏菌属占 ７．６８％ 、 拟杆菌属 Halian g ium 、 Chr y seolinea 、 鞘氨醇杆菌属( S p hinＧ
