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杨晓,梁成伟.微藻中二酰基甘油酰基转移酶基因(DGAT)结构及进化分析[J].华中农业大学学报,2018,37(06):30-39
微藻中二酰基甘油酰基转移酶基因(DGAT)结构及进化分析
Structure and evolution of diacylglycerol acyltransferase ( DGAT ) in microalgae
投稿时间:2018-01-14  
DOI:
中文关键词:  微藻  二酰基甘油酰基转移酶; 基因结构; 正选择位点; 系统发育
英文关键词:microalgae  diacylglycerol acyltransferase  gene structure  positive selection site  phylogeny 
基金项目:国家自然科学基金项目(31770393)
作者单位E-mail
杨晓 青岛科技大学海洋科学与生物工程学院青岛 266042 511653224@qq.com 
梁成伟 青岛科技大学海洋科学与生物工程学院青岛 266042 zpyangxiao1993@163.com 
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中文摘要:
      从数据库中获取微藻及高等植物中的二酰基甘油酰基转移酶基因( DGAT ),对4种酶通过基因和蛋白质结构的比较及系统发育树的构建进行多样性和进化程度分析。为了进一步分析微藻中 DGAT 的进化过程,对其进行正选择位点的检验,推测其在进化过程中受到的选择压力。结果显示:微藻中不同类型DGAT的基因结构及蛋白质结构差异较大,微藻与其他高等植物相比,同一种类型的DGAT的蛋白质结构和基因结构也有较大差别。同时发现微藻中 DGAT 同其他高等植物中的 DGAT 有不同的进化过程。选择压力分析结果显示,微藻及高等植物的 DGAT2 和 WS/DGAT 存在可信度较高的正选择位点, DGAT1 和 DGAT3 未发现正选择位点。对微藻中 DGAT 的进化研究有助于破译其在油脂积累中的作用,推动可再生能源的研究。
英文摘要:
      Microalgae is the third generation of potential bio-energy resources,and the presence of grease in microalgae is mainly triacylglycerol.Diacylglycerol acyltransferase ( DGAT ) is a key rate-limiting enzyme in the control of TAG synthesis. DGAT is divided into DGAT1 , DGAT2 , DGAT3 and WS/DGAT .The DGAT of microalgae and higher plants was obtained from the database.The diversity and evolution of the four DGAT types and gene and protein structures was analyzed with phylogenetic methods.In order to further analyze the evolution of DGAT in microalgae,the positive selection sites were selected to estimate the selection pressure in the evolutionary process.Result showed that the genetic structure and protein structure of different DGAT types in microalgae were different.In the same DGAT type,the gene structure and protein structure of microalgae was different from that of other higher plants.It was found that microalgae did have different evolutionary processes with other higher plants.There was a positive selection sites of DGAT2 and WS / DGAT .Thepositive selection sites of DGAT1 and DGAT3 were not found.It will help us to decipher its functional role in plants and promote the research of renewable energy.
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