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张靖国,田瑞,陈启亮,杨晓平,胡红菊.基于SSR标记的梨栽培品种分子身份证的构建[J].华中农业大学学报,2014,33(01):12-17
基于SSR标记的梨栽培品种分子身份证的构建
Establishment of molecular ID for pear cultirars based on SSR markers
投稿时间:2013-02-21  
DOI:1000-2421(2014)01-0012-06
中文关键词:  梨; SSR; 分子身份证  品种
英文关键词:pear  SSR  molecular ID  cultivar
基金项目:农业部农作物种质资源保护项目(NB2011-20130135-11)
作者单位E-mail
张靖国 湖北省农业科学院果树茶叶研究所武汉 430209 chongtianhe@163.com 
田瑞 湖北省农业科学院果树茶叶研究所武汉 430209  
陈启亮 湖北省农业科学院果树茶叶研究所武汉 430209  
杨晓平 湖北省农业科学院果树茶叶研究所武汉 430209  
胡红菊 湖北省农业科学院果树茶叶研究所武汉 430209 hongjuhu@sina.com 
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中文摘要:
      以20个梨栽培品种为例,利用SSR标记构建梨分子身份证体系。从分布在梨17个连锁群的60对SSR引物中筛选出分别位于17条染色体的17对多态性引物对20个梨栽培品种进行扩增,共检测到等位基因136个,每对引物检测到的等位基因数在5~11之间,平均8个;共检测到基因型203个,每个引物检测到的基因型在7~17之间,平均为12个,表明所选引物具有较高的鉴别力。多态信息含量指数(PIC)变幅为0.614~0.848,平均为0.733。38个双引物组合可区分全部供试品种。根据引物对不同品种扩增条带大小进行编码,然后将每个品种17个SSR位点的赋值依次组合,建立了20个梨栽培品种的分子身份证。
英文摘要:
      Seventeen pairs of SSR primers with clear polymorphic bands were screened from 60 pairs of SSR locus covering 17 linkage groups of pear genetic map and amplified with 20 pear cultivars.136 polymorphic bands in total were obtained with 5~11 bands per primer locus (8.0 bands on average).The polymorphism information content (PIC) of the 17 SSR loci ranged from 0.614 to 0.848 with an average of 0.733.All pear cultivars studied could be identified with 38 different combinations of 2 markers each.Bands amplified by each marker were coded based on size of fragment and used as a molecular ID.
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