昆虫化学感受蛋白基因的进化分析
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国家自然科学基金项目(31071713)和教育部高等学校博士学科点专项科研基金(20094404110019)


Evolution analysis of the insect chemosensory protein gene family
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    从基因库中调取已完成测序的昆虫化学感受蛋白(chemosensory proteins, CSPs) 基因序列和氨基酸序列,共涉及昆虫7个目23个种的59个基因。应用MEGA 5.0形成了这59个基因的系统发育关系树,并计算CSPs基因在昆虫中的核苷酸替换速率。对非同义替换速率和同义替换速率进行比较的结果显示,CSPs基因在昆虫中总体上受到负选择作用。用PAML 软件位点-特异模型检测到6个受到正选择作用的位点,其中5个位于功能重要的区域。

    Abstract:

    The phylogenetic trees of the insect chemosensory proteins (CSPs) gene from 59 sequences of CSPs in 23 species under 7 orders published in GeneBank were generated by MEGA 5.0. Complete comparisons of CSPs sequences were used to determine the rates of synonymous(Ks) and nonsynonymous(Kn) codon substitutions and the ratio of Kn/Ks was calculated to estimate of the selection pressure on CSPs genes in insects.The Kn/Ks ratio was far less than 1,suggesting that CSPs may be evolving under negative selection.By the site-specific model in PAML 4.4, 6 amino acid sites undergoing positive selection were detected,5 of them were in the important function regions.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

柳晓磊,翁群芳,胡美英,李亚楠,易 欣.昆虫化学感受蛋白基因的进化分析[J].华中农业大学学报,2011,30(2):177-181

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  • 收稿日期:2010-06-18
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