对侧耳属18个种52个菌株以及双孢蘑菇、香菇和亚侧耳各1个菌株的28SrDNA5’端、ITS和IGS1进行PCR扩增，扩增4个属的28SrDNA5’端均得到一长度为1．46kb的片段，侧耳属ITS扩增片段长680bp，亚侧耳700bp，双孢蘑菇和香菇720bp，侧耳属IGSl扩增片段长度发生变异，红平菇和桃红侧耳为1．1kb，其他侧耳为1．0kb，亚侧耳700bp，双孢蘑菇和香菇1．3kb。对扩增片段分别用7种限制性内切酶酶切后进行聚类分析，结果表明双孢蘑菇、香菇和亚侧耳可与侧耳分开，18种侧耳分为五大类：具核侧耳，红平菇和桃红侧耳，鲍鱼菇和囊盖侧耳，金顶侧耳，其他侧耳聚为一类，鲍鱼菇和囊盖侧耳，红平菇和桃红侧耳都只代表1个种。