采用5种培养基配方，对紫陀螺菌子实体不同生长期的不同部位及菌根、菌索进行组织分离，结果从子实体得到的菌丝生长缓慢，菌丝致密，从菌根和菌索得到的菌丝生长快，絮状不致密。以紫陀螺菌干子实体DNA为参照样品，对得到的相关分离纯培养物进行亲菌鉴定。供试的26条随机引物中，有8条对所有供试样品可扩增出清晰、稳定的DNA指纹图谱，且从子实体分离得到的菌丝体DNA指纹与干子实体的基本一致。聚类分析结果表明，从子实体不同生长期得到的2个菌株相似系数0.979，它们与干子实体间的相似系数为0.884，从菌根和菌索得到的分离物与干子实体间的相似系数为0.389。结果表明，从子实体分离得到的2个菌株与对照物相似度最高，可以认定是紫陀螺菌的纯培养物。