利用5个多态蛋白（酶）位点碱性磷酸酶（Akp）、蛋白酶抑制物1（PI－1)、后白蛋白1（Po-1）、后白蛋白2（Po-2）和铜蓝蛋白（Cp）分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。6个品种的平均杂合度大小依次为：南阳黑猪（0.4142）、南城黑猪（0.3057）、阳新猪（0.3032）、东乡花猪（0.2606）、杭猪（0.2478）、清平猪（0.2416），通过计算Nei（1978）标准遗传距离，用UPGMA进行聚类分析，6个品种聚成2大类：清平猪、南城黑猪、阳新猪、南阳黑猪聚成一大类；东乡花猪与杭猪聚成另一类。