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致犊牛腹泻常见病毒的检测及风险因素分析  PDF

  • 何艳飞 1,2
  • 覃城皇 1,2
  • 徐肖文 1,2
  • 冼茵儿 1,2
  • 项志杰 1,2
  • 陈颖钰 1,2,3
  • 郭爱珍 1,2,3
1. 农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室/华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院, 武汉 430070; 2. 生猪健康养殖协同创新中心/湖北省兽医流行病学国际科技合作基地, 武汉 430070; 3. 湖北洪山实验室, 武汉 430070

中图分类号: S858.23

最近更新:2025-02-14

DOI:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2025.01.019

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摘要

为了解犊牛腹泻主要病毒的流行现状和优势毒株,2021年11月至2023年10月间,运用RT-PCR技术对来自湖北、湖南、河南、广西、贵州、甘肃、山东和内蒙古等地41个牧场的264头腹泻犊牛的264份样品(58份肛拭子、15份肠组织和191份粪便)进行了牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)、牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)、牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)的检测,进一步对以上3种病毒在不同地区、年龄、季节和品种的分布进行了分析。结果显示,BRV、BCoV和BVDV的个体阳性检出率分别为14.02%(95% CI:8.44~16.68)、10.23%(95% CI:6.85~14.53)和12.12%(95% CI:10.06~18.80),78.05%(95% CI:62.39~89.44)的牧场为犊牛腹泻病毒阳性场,29.27%(95% CI:16.13~45.54)的牧场存在有混合感染,BRV与BCoV是最为常见的混合感染组合,检出率为3.42%(95% CI:1.32~5.88)。BRV在我国北方地区、冬季和≤5周龄的犊牛中检出率较高,BCoV在我国北方地区和夏冬季节检出率高,而BVDV在各地区、年龄、品种等方面,检出率无显著差异。结果表明3种病毒在我国11个省份地区的41个牧场的腹泻犊牛中普遍存在,BRV和BCoV是导致犊牛腹泻的主要病毒,并且其流行情况受到地区、季节和年龄的影响,这提示在防控措施中应该考虑这些因素。

犊牛腹泻是一种由环境因素和病原(细菌、寄生虫和病毒)共同作用所致的疾病,被认为是给养牛业造成最大经济损失的疾病之

1,严重影响着犊牛的健康。研究显示,美国南部奶牛场新生犊牛腹泻的发病率和死亡率分别为80%和20%2。2017年日本的1项年度报告称因犊牛腹泻造成的经济损失约为10亿日3。在韩国本土肉牛和奶牛中,犊牛腹泻分别导致68.7%和43.6%的死亡4。随着我国养牛业的迅速发展,牛只的南北调运日益频繁,犊牛腹泻已成为制约行业健康发展的重要因素之一。

在致犊牛腹泻病原中,病毒性病原主要包括牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)、牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)和牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)。有研究显示BRV在全球的流行率约为33.7%

5,BCoV在欧洲国家的流行率为2.80%~46.74%6,BVDV的抗原流行率高达15.74%,且在世界范围内广泛存7。我国的几项分析结果显示,BRV、BCoV和BVDV的流行率在30.8%~53.0%68-9。这3种病毒存在易变异、传播速度快、难以治疗和混合感染严重等特10。国内有关致这3种犊牛腹泻病毒的监测数据十分有限,且现有研究多集中在北方地区,有关南方地区腹泻犊牛中重要病毒流行现状的研究很少。

本研究自2021年11月至2023年10月间,运用RT-PCR技术对来自全国8个省份41个牧场的腹泻犊牛样品进行BRV、BCoV和BVDV这3种病毒的检测,并进一步分析以上3种病毒在不同地区、年龄、季节和品种的分布,确定我国部分地区腹泻犊牛中BRV、BCoV和BVDV的感染现状及可能的风险因素,以期为犊牛腹泻的精准防控提供重要的流行病学基础参考。

1 材料与方法

1.1 样本来源

2021年11月至2023年10月间收集来自湖北、湖南、河南、广西、贵州、甘肃、山东和内蒙古等地的41个牧场的264头腹泻犊牛的264份样品(58份肛拭子、15份肠组织和191份粪便),每头牛取1个样品。具体分布和数量如表1所示。

表1  样品地区分布情况
Table 1  Regional distribution of samples

省份

Provinces

牧场数量

Number of ranches

样品数量/份

Number of samples

湖北 Hubei 17 111
甘肃 Gansu 5 38
湖南 Hunan 6 34
河南 Henan 3 27
贵州 Guizhou 2 16
山东 Shandong 2 14
浙江 Zhejiang 1 9
青海 Qinghai 2 4
河北 Hebei 1 3
内蒙古 Inner Mongolia 1 3
安徽 Anhui 1 2

1.2 材料和试剂

Virus DNA/RNA Extraction Kit FT 2.0和反转录试剂盒HiScript Ⅱ Q RT Super Mix for qPCR购自南京诺唯赞生物科技股份有限公司。1.1×T3 Super PCR Mix、DNA Marker、TS-GelRed 核酸凝胶染料购自北京擎科生物科技股份有限公司。引物由北京擎科生物科技有限公司合成。

1.3 样品处理

1)粪便样品。使用棉签取5~6 g粪便样品,加入3倍体积的生理盐水充分振荡混匀,8 000 r/min离心10 min后吸取上清液,反复冻融后保存于-80 ℃冰箱,备用。

2)肛拭子样品。在肛拭子样品加入约3倍体积的生理盐水充分振荡混匀,8 000 r/min离心10 min后吸取上清液,反复冻融后保存于-80 ℃冰箱,备用。

3)组织样品。取有病变的组织(5 mm×5 mm左右),使用无菌剪刀在2 mL微量离心管中剪碎组织,加入无菌的研磨珠,使用匀浆机研磨,10 000 r/min离心5 min,吸取上清液,反复冻融后保存于-80 ℃冰箱,备用。

1.4 核酸检测

取冻融后的上清液,按照DNA/RNA快速提取试剂盒使用说明书提取样本RNA并利用逆转录试剂盒HiScript Ⅱ Q RT SuperMix for qPCR(+gDNA wiper)逆转录为cDNA,存放于-20 ℃冰箱备用。PCR以处理好的样本为模板进行BRV、BVDV和BCoV的检测。本研究所用引物和目的片段大小如表2所示。BVDV和BRV采用PCR进行检测,反应条件分别为:98 ℃ 2 min;98 °C 10 s,退火温度分别为59.3 ℃(BVDV)/55.4 ℃(BRV)12 s,72 ℃ 15 s,35个循环;72 ℃ 5 min。

表2  引物信息和序列
Table 2  Primer information and sequences

病毒Virus

(目的基因 Target gene)

引物

Primer

序列(5′-3′)

Sequences

长度/bp

Size

文献

Reference

BVDV

(5′UTR)

F GCCATGCCCTTAGTAGGACTAGC 290 [11]
R CAACTCCATGTGCCATGTACAGC

BRV

(VP6)

F ACCACCAAATATGACACCAGC 294 [12]
R CATGCTTCTAATGGAAGCCAC

BCoV

(S)

F CTATACCCAATGGTAGGA 885 [13]
R CTGAAACACGACCGCTAT
F GTTTCTGTTAGCAGGTTTAA 488
R ATATTACACCTATCCCCTTG

BCoV采用巢式PCR进行检测,首轮反应条件为:98 ℃ 2 min;98 ℃ 10 s,50.3 ℃ 10 s;72 ℃ 15 s,35个循环;72 ℃ 5 min。取第1轮的产物作为模板进行第2轮PCR程序,98 ℃ 2 min;98 ℃ 10 s,49.3 ℃ 10 s;72 ℃ 15 s,35个循环;72 ℃ 5 min。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测,大小正确的阳性条带送北京擎科生物公司公司测序,得到的序列利用NCBI网站的Blast功能进行比对。

1.5 风险因素分析

通过前期对犊牛信息的处理和筛选,选择犊牛年龄、季节、地区和品种作为风险因素,探究这4种因素与3种病毒的阳性检出率的关联。此外,为有效指导临床样本采集及监测,对不同类型的样本也进行了分析研究。采用卡方检验对年龄、季节、地区和品种等影响因素做单因素分析,P<0.05,表示差异具有统计学意义,采用广泛应用的Logistic回归分析方法对差异显著的风险因素进行二元Logistic回归分

14,判定各风险因素的影响程度。

2 结果与分析

2.1 腹泻犊牛信息统计

对收集的264头腹泻犊牛的品种、收集季节、收集地区、年龄和样本类型进行统计。在本研究中,基于样本数量匹配的原则,将年龄依照≤5周龄和>5周龄进行分类,季节按照春季(3—5月)、夏季(6—8月)、秋季(9—11月)和冬季(12、1和2月)分类,而牛的品种划分为肉牛(西门塔尔牛、安格斯牛和本土肉牛)和奶牛(荷斯坦牛),样品的地区以秦岭淮河为分界线被划分为南方和北方,此外将粪便作为1个类型,肠组织和肛拭子合并为1个类型(表3)。

表3  腹泻犊牛信息分布
Table 3  Distribution of information on diarrhea calves

腹泻犊牛信息

Diarrhea calf information

占比/%

Percentage

周龄

Weeks of age

≤5 40.32(102/253)
>5 59.68(151/253)
季节 Season 春季 Spring 24.24(64/264)
夏季 Summer 24.24(64/264)
秋季 Autumn 17.80(47/264)
冬季 Winter 33.71(89/264)
品种Species 肉牛 Beef cattle 70.75(179/253)
奶牛 Dairy cattle 29.25(74/253)
地区 Area 南方 South 65.13(170/261)
北方 North 34.87(91/261)
样品类型 Sample type 粪便 Stool 66.29(175/264)
肛肠拭子 Anorectal swab 33.71(89/264)

2.2 BRV、BCoV和BVDV的阳性检出率

利用RT-PCR对264份临床样品进行检测,PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测,大小正确的条带送公司测序,得到的所有BRV、BCoV和BVDV的序列,大小分别在294、488和290 bp左右,得到的序列利用NCBI网站的Blast功能进行比对,均为对应的病毒(图1)。其中检测到任意一种病毒的牧场被定义为阳性牧场。结果显示,78.05%(95% CI:62.39~89.44)的牧场为阳性牧场,个体水平上,BRV、BCoV和BVDV的阳性检出率分别为14.02%(95% CI:8.44~16.68)、10.23%(95% CI:6.85~14.53)和12.12%(95% CI:10.06~18.80),且这3种病毒的阳性检出率无显著差异(P>0.05)(表4)。

图1  BRV(A)、BCoV(B)和BVDV(C)的部分序列比对结果

Fig. 1  Partial sequence alignment results of BRV(A),BCoV(B)and BVDV(C)

黑色框表示同源性最高的序列。Black box indicates the sequence with the highest homology.

表4  BRV、BCoV和BVDV的阳性检出率
Table 4  Positivity rate of BRV,BCoV and BVDV

病原

Pathogens

阳性检出率/%

Positivity rate

95% CI
BRV 14.02(37/264) 10.1~18.8
BCoV 10.23(27/264) 6.8~14.5
BVDV 12.12(32/264) 8.4~16.7

进一步对多病毒混合感染情况进行了分析,结果发现最为常见的病毒感染组合为BRV与BCoV,阳性检出率最高3.03%(95% CI:1.32~5.88),而BRV与BVDV和BCoV与BVDV阳性检出率分别为0.38%(95% CI:0.01~2.09)和0.76%(95% CI:0.09~2.71),具体信息如表5所示。

表5  病毒混合感染类型和混合感染率
Table 5  Types of viral co-infections and co-infection rates

病原

Pathogens

阳性检出率/%

Positivity rate

95% CI
BRV+BCoV 3.03(8/264) 1.32~5.88
BRV+BVDV 0.38(1/264) 0.01~2.09
BCoV+BVDV 0.76(2/264) 0.09~2.71

2.3 不同年龄与犊牛感染BRV、BCoV和BVDV的关联

在264份犊牛样品中,11份无年龄信息,因此在进行年龄分析时将其剔除。由表6表7可知,余下的253头腹泻犊牛中,≤5周龄犊牛中,BRV的阳性检出率达到了25.49%(95% CI:17.38~35.08),显著高于>5周龄的犊牛(P<0.05)。≤5周龄的腹泻犊牛感染BRV的风险是>5周龄腹泻犊牛的4.35倍(OR=4.35,95% CI: 2.04~9.29)。而在≤5周龄犊牛中,BCoV的阳性检出率是12.75%(95% CI:6.96~20.81),高出>5周龄的犊牛的阳性检出率9.27%(95% CI:5.16~15.07)。BVDV在>5周龄的犊牛的阳性检出率为14.57%(95% CI:9.36~21.22),高于≤5周龄犊牛的阳性检出率。BCoV与BVDV在>5周龄与≤5周龄的犊牛中阳性检出率无显著差异(P>0.05)。

表6  不同周龄腹泻犊牛3种病毒阳性检出率
Table 6  Positivity rate of the 3 viruses in diarrhea calves at different weeks of age

周龄

Weeks of age

BRVBCoVBVDV

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity

95% CI
≤5 25.49(26/102) 17.38~35.08 12.75(13/102) 6.96~20.81 6.86(7/102) 2.80~13.63
>5 7.28(11/151) 3.69~12.66 9.27(14/151) 5.16~15.07 14.57(22/151) 2.80~13.63
表7  周龄与3种病毒阳性检出率卡方检验的P值和相关系数比值(OR)
Table 7  The P values and correlation coefficient ratios (OR) of the chi-square test for weeks of age and positivity rate of the 3 viruses

周龄

Weeks of age

BRVBCoVBVDV
PP valueOR95% CIPP valueOR95% CIPP valueOR95% CI
≤5 <0.001 4.35 2.04~9.29 0.059 1.43 0.64~3.18 0.380 0.43 0.18~1.05
>5 1.00 0.11~0.49 1.00 0.31~1.56 1.00 0.95~5.64

2.4 不同季节与犊牛感染BRV、BCoV和BVDV的关联

表8表9可以看出,BRV在四季都有检出,其中在冬季的阳性检出率最高为23.60%(95% CI:15.24~33.78),最低是在秋季,也高达8.51%(95% CI:2.37~20.38),在春、夏季的阳性检出率相同。此外,犊牛感染BRV的风险在不同季节差异显著(P<0.05),在冬季犊牛感染BRV的风险分别是春季、夏季和秋季的2.99、2.99和3.32倍(OR=3.32,95% CI:1.07~10.33)。BCoV在夏季的阳性检出率最高,为14.06%(95% CI:5.16~15.07),在其他季节的阳性检出率为6.38%~13.48%(95% CI:0.98~22.37),不同季节对这3种病毒无显著影响差异(P>0.05)。BVDV在四季的检出率为10.11%~14.06%(95% CI:4.73~25.74),每个季节阳性检出率差异不显著(P>0.05)。以上结果表明,相对于其他季节,冬季BRV发生的频率更高,其他病毒在不同季节流行情况均无显著差异。

表8  不同季节腹泻犊牛3种病毒的阳性检出率
Table 8  Positivity rate of the 3 viruses in diarrhea calves in different seasons

季节

Season

BRVBCoVBVDV

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI
春季 Spring 9.38(6/64) 3.52~19.30 4.69(3/64) 0.98~13.09 12.50(8/64) 5.55~23.15
夏季 Summer 9.38(6/64) 3.52~19.30 14.06(9/64) 6.64~25.02 14.06(9/64) 6.64~25.02
秋季 Autumn 8.51(4/47) 2.37~20.38 6.38(3/47) 1.34~17.54 12.77(6/47) 4.83~25.74
冬季Winter 23.60(21/89) 15.24~33.78 13.48(12/89) 7.17~22.37 10.11(9/89) 4.73~18.33
表9  季节与3种病毒阳性检出率卡方检验的P值和相关系数比值(OR)
Table 9  P values and correlation coefficient ratios of the chi-square test for season and positivity rate of the 3 viruses

季节

Season

BRVBCoVBVDV
PP valueOR95% CIPP valueOR95% CIPP valueOR95% CI
春季 Spring 0.017 1.11 0.30~4.18 0.176 1.00 0.19~5.15 0.899 1.27 0.46~3.49
夏季 Summer 1.11 0.30~4.18 3.33 0.86~12.92 1.45 0.54~3.90
秋季 Autumn 1.00 0.23~4.26 1.39 0.27~7.19 1.30 0.43~3.91
冬季Winter 3.32 1.07~10.33 3.09 0.83~11.43 1.00 0.38~2.65

2.5 不同地区与犊牛感染BRV、BCoV和BVDV的关联

基于样本数量匹配的原则以及剔除未知地区来源的3份样品,将261份样品来源地区按照秦岭淮河分界线划分为南方地区和北方地区。表10表11的结果显示,BRV在北方地区的阳性检出率为24.18%(95% CI:15.81~34.28),远高于南方地区的阳性检出率8.82%(95% CI:5.02~14.14),在南北两地区犊牛中BRV检出率差异显著(P<0.05),在北方地区犊牛检出BRV的风险是南方的3.29倍(OR=3.29,95% CI: 1.61~6.73)。同样值得注意的是,BCoV在北方的阳性检出率为20.88%(95% CI:16.70~38.10)远高于南方地区的阳性率4.71%(95% CI:2.05~9.06);此外,BCoV的阳性检出率在南北地区差异显著(P<0.05),在北方地区犊牛检出BCoV的概率是南方的5.34倍(OR=5.34,95% CI: 2.24~12.71)。而BVDV在南方地区的阳性检出率要高于北方地区,南方地区的阳性检出率为12.35%(95% CI:7.81~18.26),而北方的阳性检出率为8.79%(95% CI:3.87~16.59),表明两者差异不显著(P>0.05)。

表10  不同地区3种病毒的阳性检出率
Table 10  Positivity rate of the 3 viruses in different area

地区

Area

BRVBCoVBVDV

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI
南方 South 8.82(15/170) 5.02~14.14 4.71(8/170) 2.05~9.06 12.35(21/170) 7.81~18.26
北方 North 24.18(22/91) 15.81~34.28 20.88(19/91) 16.70~38.10 8.79(8/91) 3.87~16.59
表11  地区与3种病毒阳性检出率卡方检验的P值和相关系数比值(OR)
Table 11  P values and correlation coefficient ratios of the chi-square test for area and positivity rate of the 3 viruses

地区

Area

BRVBCoVBVDV
PP valueOR95% CIPP valueOR95% CIPP valueOR95% CI
南方 South <0.001 1.00 0.15~0.62 <0.001 1.00 0.08~0.45 0.761 1.00 0.62~3.45
北方 North 3.29 1.61~6.73 5.34 2.24~12.71 0.68 0.29~1.61

2.6 不同品种与犊牛感染BRV、BCoV和BVDV的关联

在264份犊牛样品中,11份无品种信息,将其剔除。表12表13的结果显示,BRV、BCoV及BVDV在肉牛中的阳性检出率为15.64%(95% CI:10.65~21.81)、10.61%(95% CI:6.51~16.08)和13.97%(95% CI:9.25~19.92),在奶牛中的阳性检出率为12.16%(95% CI:5.71~21.84)、10.81%(95% CI:4.78~20.20)和5.41%(95% CI:1.49~13.27)。不同品种的犊牛3种病毒的检出率无显著差异。

表12  不同品种3种病毒的阳性检出率
Table 12  Positivity rate of the 3 viruses in different species

品种

Species

BRVBCoVBVDV

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI
肉牛 Beef cattle 15.64(28/179) 10.65~21.81 10.61(19/179) 6.51~16.08 13.97(25/179) 9.25~19.92
奶牛 Dairy cattle 12.16(9/74) 5.71~21.84 10.81(8/74) 4.78~20.20 5.41(4/74) 1.49~13.27
表13  不同品种与3种病毒阳性检出率卡方检验的P值和相关系数比值(OR)
Table 13  P values and correlation coefficient ratios of different species to the chi-square test for positivity rate of the 3 viruses

品种

Species

BRVBCoVBVDV

P

P value

OR95% CI

P

P value

OR95% CI

P

P value

OR95% CI
肉牛 Beef cattle 0.476 1.34 0.60~3.00 0.963 2.84 0.95~8.47 0.052 0.83 0.38~1.78
奶牛 Dairy cattle 1.00 0.33~1.67 1.00 0.12~1.05 1.00 0.56~2.60

2.7 二元Logistic回归分析

单因素分析结果显示:对于BVDV,犊牛周龄、季节、地区和品种不是风险因素,而BCoV只有地区因素是风险因素,犊牛的周龄、季节和品种并不是风险因素,只有BRV符合多因素分析方法,分析方法使用二元Logistic回归分析,选择以犊牛的年龄、地区和季节等风险因素作为自变量,是否检出BRV为因变量建立二元Logistic回归模型,回归模型成立(Omnibus检验χ2为30.35,P<0.001),模型拟合度效果较好(χ2为3.58,P=0.893>0.05)。

二元Logistic多因素回归分析结果如表14所示。由表14可知,相较南方地区,北方地区的检出BRV的风险更大,差异具有统计学意义(P<0.05,OR=4.03,95% CI:10.65~21.81)。≤5周龄的犊牛的检出BRV的风险是>5周龄犊牛的4.59倍,差异具有统计学意义(P<0.05,OR=4.59,95% CI:1.41~11.55)。在冬季犊牛检出BRV的风险更大,差异具有统计学意义(P<0.05,OR=3.42,95% CI:1.76~15.33)。

表14  二元Logistic多因素回归分析结果
Table 14  Results of binary logistic multifactor regression analysis

风险因素

Risk factors

BSDWalsPOR

置信区间

95% CI

周龄 Weeks of age 1.40 0.54 6.75 0.009 4.59 1.41~11.55
地区 Region 1.52 0.41 13.57 <0.001 4.03 2.04~10.31
季节 Season 3.01 0.39
春季 Spring 1.04 0.68 2.31 0.13 2.82 0.74~10.80
夏季 Summer 0.91 0.73 1.57 0.21 2.49 0.60~10.38
冬季 Winter 1.23 0.77 2.57 0.02 3.42 1.76~15.33
常量Constant -4.08 0.72 32.57 <0.001 0.017

注:  B为参数估计值,SD为标准误差,OR(比数比:为事件发生的概率与不发生的概率之比),Wals为瓦尔德值;95% CI为95%置信区间。Note: B is the parameter estimate; SD is the standard error; OR (ratio: ratio of the probability of occurrence); Wals is Wald; 95% CI is 95% confidence interval.

2.8 不同样本类型与BRV、BCoV和BVDV阳性检出率的关联

为了确定用于检测BRV、BCoV和BVDV的最佳采样方案,本研究对不同样本类型进行了分析。由表15可知,BRV、BCoV和BVDV在粪便类型的样品阳性检出率分别为11.43%(95% CI:10.65~21.81)、9.34%(95% CI:6.51~16.08)和11.43(95% CI:9.25~19.92),低于肛肠拭子在BRV、BCoV和BVDV的阳性检出率。由表16可知,3种病毒的阳性检出率与样品类型之间差异均不显著(P>0.05),表明样本类型不同并不会影响3种病毒的阳性检出率。

表15  不同样本类型3种病毒的阳性检出率
Table 15  Positivity rate of the 3 viruses in different sample types

样品类型

Sample type

BRVBCoVBVDV

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI

阳性率/%

Positivity rate

95% CI
粪便 Stool 11.43(20/175) 10.65~21.81 9.34(16/175) 6.51~16.08 11.43(20/175) 9.25~19.92
肛肠拭子 Anorectal swab 19.10(17/89) 5.71~21.84 12.36(11/89) 4.78~20.20 12.50(12/89) 1.49~13.27
表16  样本类型与3种病毒阳性检出率卡方检验的P值和相关系数比值(OR)
Table 16  P value and correlation coefficient ratios of sample type to the chi-square test for positivity rate of the 3 viruses

样品类型

Sample type

BRVBCoVBVDV

P

P value

OR95% CI

P

P value

OR95% CI

P

P value

OR95% CI
粪便 Stool 0.090 0.55 0.27~1.11 0.415 0.71 0.32~1.61 0.629 0.83 0.38~1.78
肛肠拭子 Anorectal swab 1.00 0.90~3.70 1.00 0.62~3.16 1.00 0.56~2.60

3 讨论

为了解BRV、BCoV和BVDV在腹泻犊牛中的流行情况,通过对不同年龄、地区、品种、季节和样品类型进行分析,发现这3种病毒在我国犊牛中感染严重,且存在混合感染,其中最为常见的感染组合为BRV与BCoV,与其他研究结果类

815

本次腹泻犊牛中的BRV的总阳性检出率为14.02%(95% CI:8.44~16.68),低于部分文献报道的国内BRV平均感染率35.3%

16(例如在宁夏、河北唐山和山东BRV的感染率分别为53.39%10、29.44%17和17.70%18),其原因主要是因为病毒的流行情况受到时间、空间和管理因素等多方面的影19。本项研究的样品主要来源于华中地区,相对北方地区,华中地区肉牛养殖规模略低,且防控水平略高,因此有着相对北方更低的检出20。但从结果而言,能够表现为较高的感染情况。对比5周龄以上的犊牛,5周龄以下的犊牛检出BRV的风险更高,其他研究人员也报道了类似的发1921,不同年龄犊牛BRV的阳性检出率均差异显著(P<0.05),或许是由于犊牛的免疫系统不完善导致BRV的传22,这表明更需要加强对5周龄以下的BRV的早期防控。从样品的采集季节来看,BRV在冬季的阳性检出率最高23.06%(95% CI:15.24~33.78),这和以前显示BRV在冬季流行的结果一23。这意味着温度的下降,对于BRV的传播是有利的。就地区而言,中国北方地区BRV的阳性检出率显著高于南方地区(P<0.05),这可能是因为北方地区寒冷,以及饲养量大造成的。这提示我们需要对北方地区5周龄以下的犊牛进行更多的监测,特别是在冬季,以便尽早发现,及时采取控制措施。

BCoV的流行与BRV有着相同的趋势。本研究中的检测结果略低于文献报道的北方流行情况。此外本次检测结果显示:BCoV在冬季以及北方地区阳性检出率最高,且北方地区的阳性检出率与南方地区差异显著(P<0.05)。这部分结果不仅与我们的阳性检出情况相吻合,也表明在北方更要加强卫生管理和温度控制,加强圈舍、设备和工具的卫生管理,确保牧场清洁卫生。提供合适的牛舍供犊牛避寒,确保牛舍温度适宜,避免低温对犊牛的影响。

本研究在32.20%(85/264)的腹泻样品检测出3种病毒的核酸,其他的腹泻样品未检出病毒核酸,而造成犊牛腹泻的不仅有病毒,还有细菌和寄生虫。在一项关于腹泻犊牛的病原学调查结果显示:细菌与寄生虫的检出率为35.00%(77/220),病毒的检出率为12.27%(27/220

21。其次饲养环境和气候等也会影响犊牛腹泻发病24,例如在本研究中,部分未检出病毒的样品是在特别寒冷或者是温差较大的时期得到的。因此,在预防和控制犊牛腹泻方面,除了关注病毒的防控外,还需要综合考虑细菌、寄生虫和环境等多方面因素,采取综合性的防控措施,以降低犊牛腹泻的发病率。

犊牛腹泻是养牛业中一项常见且重要的疾病,对养牛业经济造成了严重损失。确定我国部分省份犊牛腹泻病毒流行的现状和相关风险因素,有助于对养牛场犊牛腹泻病的精准防控。本研究结果显示BRV、BVDV和BCoV在中国部分省份地区广泛分布,且存在有混合感染。在北方地区,冬季和≤5周龄的牛,BRV的检出率高;北方地区的犊牛BCoV的检出率更高;BVDV在犊牛中的检出率,不受地区、品种、季节和年龄的影响。

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