摘要
为构建番茄生态优质高产栽培技术体系及挖掘有益的微生物资源，比较了不同生育期番茄植株根际土壤肥力以及微生物群落结构与功能特征。基于传统与现代高通量测序技术分析番茄幼苗期、花芽分化期、结果期根际土壤肥力与微生物（细菌、真菌）群落结构与功能特征。结果显示，番茄结果期根际土壤中具有更为丰富的碳、氮、磷源；另一方面，不同生育期番茄根际土壤微生物群落结构和功能发生显著变化。其中，norank_f_norank_o_norank_c_KD4-96，norank_f_A4b和Bryobacter属细菌是幼苗期番茄植株根际土壤中特有的优势细菌属；TM7a和Saccharomonospora属细菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中特有的优势细菌属；Gemmatimonas属细菌是结果期番茄植株根际土壤中特有的优势细菌属；此外，鲍尔壶菌属（Powellomyces）真菌是幼苗期番茄植株根际土壤中特有的优势真菌属；Apiotrichum和unclassified_f_Chytridiaceae真菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中特有的优势真菌属；链格孢属（Alternaria）真菌是结果期番茄植株根际土壤中特有的优势真菌属。结果表明：不同生育期番茄植株根际土壤中形成了特异的根际土壤微生物群落，幼苗期根际土壤中主要富集了可以产生生长激素的微生物类群；花芽分化期根际土壤中主要富集了具有抗逆功能的微生物类群；结果期根际土壤中主要富集了具有促进养分循环功能的微生物类群。
番茄（Solanum lycopersicum L.）是茄科番茄属1年生或多年生草本植物，因其果实风味独特、营养丰富，已在全球范围内广泛种植，我国已经成为全世界产量最高的番茄生产国。番茄及其根系生长代谢活动可以改变土壤理化性质，影响番茄及其根系的生长代谢，共同调控根际土壤微生物群落结构和丰度的变
由于番茄在不同生育期内对营养物质的积累与转化不同，因此，探究番茄不同生育期根际土壤微生物变化特征有助于挖掘有益微生物资源。目前尚未见对于不同生育期番茄土壤及根际微生物群落组成的研究报道，本研究通过测定不同生育期番茄根际土壤生物学性状以及番茄根际土壤细菌真菌群落结构组成，解析番茄在不同生育期根际土壤微生物群落变化特征，旨在为筛选具有延缓番茄植株衰老、提高番茄产量和品质的有益功能微生物，构建番茄生态优质高产栽培技术体系提供理论依据和技术支撑。
试验番茄品种为中研868（购自南宁市蔬菜种子市场），在广西大学农学院蔬菜基地（108°17′25″E，22°51′02″N）进行试验。采用盆栽（盆高35 cm、直径50 cm）方式进行种植。盆中装入土壤约20 kg，土壤类型为赤红壤；各处理田间管理措施（如施肥和灌溉等）均相同。
土壤理化性状如下：pH 5.71，有机质含量8.42 g/kg，全氮含量0.51 g/kg，全磷含量0.67 g/kg，全钾含量7.21 g/kg；速效磷含量0.59 mg/kg，速效钾含量51.01 mg/kg，碱解氮含量13.17 mg/kg。
分别于2021年9月10日、10月10日、11月10播种、育苗，每盆种植1株番茄，每个生育期15盆。于2021年12月20日同时采集番茄幼苗期（播种后30 d）、花芽分化期（播种后60 d）、结果期（播种后91 d）根际土壤样品。每个处理随机选取5株长势一致的番茄植株，以植株为中心，用消毒铁铲铲松半径约25 cm的圆圈土层后，然后手握植株茎基部，拔取整个番茄植株。采用抖根
根际土壤样品总DNA提取、PCR扩增和序列测定均由上海美吉生物医药科技有限公司完成。使用Miseq平台进行高通量测序。
根据FastDN
引物名称 Primer name | 引物类型 Primer type | 引物序列 Primer sequence （5′→3′） | 测序平台 Sequencing platform | 序列长度/bp Sequencing length |
|---|---|---|---|---|
|
338F 806R |
土壤细菌16S rRNA Soil bacteria |
ACTCCTACGGGAGGCAGCAG GGACTACHVGGGTWTCTAAT |
MiSeqPE250
MiSeqPE300 | 416 |
| ITS1F |
土壤真菌ITS Soil fungi | CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA | 242 | |
| ITS2R | GCTGCGTTCTTCATCGATGC |
Illumina Miseq测序：利用AxyPrep DNA Gel Extraction Kit （Axygen Biosciences， Union City， CA， USA）将同一样本的PCR产物进行回收产物纯化，混合后使用2%琼脂糖凝胶进行回收检测，并用Quantus™ Fluorometer （Promega，美国） 对回收产物进行检测定量。使用NEXTFLE
利用Illumina公司的MiseqPE250平台进行测序（上海美吉生物医药科技有限公司）。原始数据上传至NCBI数据库中进行比对。
土壤β-葡糖苷酶活性测定参照文献［
由
生育期 Growth stage | β-葡糖苷酶 β-glucosidase | 磷酸酶 Phosphatase | 氨肽酶 Aminopeptidase |
|---|---|---|---|
|
幼苗期 Seedling stage | 1.11±0.32c | 1.97±1.10b | 9.62±1.37a |
|
花芽分化期 Flower bud differentiation stage | 1.63±0.12b | 1.55±0.19b | 9.89±2.42a |
| 结果期Fruiting stage | 2.08±0.12a | 3.69±0.40a | 10.21±2.81a |
注： 表中数据为平均值±标准差。同列字母不同表示处理间差异显著（P<0.05）。下同。Note：Data in the table are means ± SD. Different letters in the same column mean significant difference between each treatment at P<0.05. The same as below.
由
生育期 Growth stage | 微生物生物量碳 Microbial biomass C | 微生物生物量氮 Microbial biomass N | 微生物生物量磷 Microbial biomass P |
|---|---|---|---|
| 幼苗期 Seedling stage | 198.41±5.29b | 116.24±17.08a | 235.84±101.76a |
| 花芽分化期 Flower bud differentiation stage | 63.21±10.06c | 79.65±16.43b | 19.67±12.34c |
| 结果期 Fruiting stage | 280.39±49.69a | 89.44±7.02ab | 195.53±49.41ab |
由
图1 不同生育期番茄植株根际土壤细菌OTU水平的Chao指数（A）、Shannon指数（B）、Ace指数（C）、PCoA（D）和PLS-DA（E）分析
Fig. 1 The Chao index （A）， the Shannon index（B） ，Ace index （C），PCoA（D） and PLS-DA（E） analyses of soil bacteria in rhizospheres under different growth stages at OTU level
Ⅰ.幼苗期 Seedling stage； Ⅱ.花芽分化期 Flower bud differentiation stage； Ⅲ.结果期 Fruiting stage.下同 The same as follows.
基于OTU水平的细菌PCoA分析结果显示，PC1轴和PC2轴的解释度分别为46.03%和21.6%；表明番茄幼苗期、花芽分化期和结果期植株根际土壤细菌群落结构存在显著差异（P<0.05），物种组成结构相似度低（
在属分类水平上，不同生育期番茄植株根际土壤中，共有优势细菌属的数量为671个。幼苗期、花芽分化期、结果期番茄植株根际土壤中特有的优势细菌分别有44、22、38个（
图2 不同生育期番茄植株根际土壤细菌属（A）和OTU（B）分类水平Venn图
Fig. 2 Venn diagram of soil bacteria in rhizospheres of tomatoes under different growth stages at genus（A） and OTU（B） levels
OTU分类水平上，不同生育期番茄植株根际土壤中，共有优势细菌OTU数量为2 776个；幼苗期、花芽分化期、结果期特有的优势细菌数分别有480、139、242个（
上述结果表明，无论是属或OTU分类水平，均以幼苗期番茄根际土壤中特有的优势细菌数量为最高，其次分别为结果期和花芽分化期。
1）门分类水平。由
图 3 番茄不同生育期根际土壤细菌门（A）和属（B）分类水平相对占比
Fig. 3 Soil bacterial phylum （A） and genus levels（B） in rhizospheres of tomato under different growth stages
幼苗期番茄植株根际土壤中，优势细菌门相对丰度占比大小顺序依次为：变形菌门（Proteobacteria，33.92%）、放线菌门（Actinobacteriota，22.60%）、酸杆菌门（Acidobacteriota，14.88%）、绿弯菌门（Chloroflexi，11.89%）、拟杆菌门（Bacteroidota，4.41%）、芽单胞菌门（Gemmatimonadota，3.19%）、厚壁菌门（Firmicutes，2.12%）、Patescibacteria（1.44%）、黏菌门（Myxococcota，1.00%）和其他（others，4.59%）。
花芽分化期番茄植株根际土壤中，优势细菌门相对丰度占比大小顺序依次为：变形菌门（Proteobacteria，36.07%）、放线菌门（Actinobacteriota，22.75%）、绿弯菌门（Chloroflexi，10.25%）、酸杆菌门（Acidobacteriota，9.08%）、拟杆菌门（Bacteroidota，6.30%）、芽单胞菌门（Gemmatimonadota，3.73%）、厚壁菌门（Firmicutes，3.19%）、Patescibacteria（2.96%）、黏菌门（Myxococcota，1.02%）和其他（others，4.65%）。
结果期番茄植株根际土壤中，优势细菌门相对丰度占比大小顺序依次为：变形菌门（34.01%）、放线菌门（20.27%）、酸杆菌门（11.19%）、绿弯菌门（10.00%）、拟杆菌门（7.40%）、芽单胞菌门（4.42%）、厚壁菌门（3.01%）、Patescibacteria（2.83%）、黏菌门（2.01%）和其他（4.87%）。
以上结果表明，在门分类水平上，虽然不同生育期番茄植株根际土壤中优势细菌群落组成相同，但不同优势细菌门类的相对丰度占比发生了显著变化。其中，绿弯菌门细菌在番茄花芽分化期中的丰度占比排序发生明显变化，均由幼苗期和结果期的第4位上升至第3位；而在番茄幼苗期和结果期中丰度占比第3位的酸杆菌门细菌在花芽分化期则下降至第4位。
2）属分类水平。幼苗期、花芽分化期和结果期番茄植株根际土壤中，优势细菌属（相对丰度大于1%）分类数量分别有24、24和19（
幼苗期番茄植株根际土壤中，相对丰度占比由高到低排序为：鞘氨醇单胞菌属（5.03%）、溶杆菌属（4.91%）、norank_f_norank_o_Vicinamibacterales（3.32%）、norank_f_Vicinamibacteraceae（2.86%）、RB41（2.70%）、马杜拉放线菌属（Actinomadura，2.48%）、norank_f_SC-I-84（1.86%）、norank_f_Gemmatimonadaceae（1.84%）、Chujaibacter（1.82%）、norank_f_norank_o_Gaiellales（1.79%）、Haloactinopolyspora（1.74%）、节细菌属（Arthrobacter，1.70%）、norank_f_JG30-KF-CM45（1.63%）、norank_f_67-14（1.62%）、unclassified_f_Xanthobacteraceae（1.49%）、norank_f_JG30-KF-AS9（1.31%）、Gaiella（1.30%）、norank_f_Roseiflexaceae（1.27%）、norank_f_norank_o_norank_c_KD4-96（1.27%）、Flavisolibacter（1.18%）、交替赤杆菌属（Altererythrobacter，1.12%）、norank_f_A4b（1.12%）、Bryobacter（1.04%）、Microvirga（1.01%）和其他（49.79%）。
花芽分化期番茄植株根际土壤中，相对丰度占比由高到低排序为：鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas，4.28%）、溶杆菌属（Lysobacter，3.98%）、马杜拉放线菌属（Actinomadura，3.16%）、norank_f_norank_o_Vicinamibacterales（2.75%）、Chujaibacte（2.23%）、Haloactinopolyspora（2.23%）、norank_f_Vicinamibacteraceae（2.09%）、norank_f_Gemmatimonadaceae（1.94%）、norank_f_norank_1.72%）、norank_f_SC-I-84（1.83%）、norank_f_67-14（1.42%）、Flavisolibacter（1.40%）、交替赤杆菌属（Altererythrobacter，1.37%）、unclassified_f_Xanthobacteraceae（1.36%）、norank_f_Roseiflexaceae（1.31%）、节细菌属（Arthrobacter，1.29%）、TM7a（1.27%）、德沃斯氏菌属（Devosia，1.23%）、Gaiella（1.21%）、RB41（1.17%）、norank_f_JG30-KF-AS9（1.11%）、Microvirga（1.04%）、Saccharomonospora（1.03%）。
结果期番茄植株根际土壤中，相对丰度占比由高到低排序分别为：马杜拉放线菌属（Actinomadura，3.53%）、norank_f_norank_o_Vicinamibacterales（3.39%）、鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas，2.68%）、Chujaibacter（2.61%）、Haloactinopolyspora（2.44%）、溶杆菌属（Lysobacter，2.43%）、norank_f_Vicinamibacteraceae（2.00%）、TM7a（1.82%）、unclassified_f_Xanthobacteraceae（1.62%）、norank_f_67-14（1.55%）、norank_f_Roseiflexaceae（1.46%）、norank_f_JG30-KF-CM45（1.44%）、norank_f_norank_o_Gaiellales（1.36%）、norank_f_Gemmatimonadaceae（1.27%）、交替赤杆菌属（Altererythrobacter，1.17%）、norank_f_SC-I-84（1.16%）、节细菌属（1.11%）、Gemmatimonas（1.09%）、德沃斯氏菌属（Devosia，1.08%）。
综上，不同生育期番茄植株根际土壤中，鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）、溶杆菌属（Lysobacter）、马杜拉放线菌属（Actinomadura）、norank_f_norank_o_Vicinamibacterales、Chujaibacter、Haloactinopolyspora、norank_f_Vicinamibacteraceae、norank_f_Gemmatimonadaceae、norank_f_SC-I-84、norank_f_norank_o_Gaiellales、norank_f_JG30-KF-CM45、norank_f_67-14、交替赤杆菌属（Altererythrobacter）、unclassified_f_Xanthobacteraceae、norank_f_Roseiflexaceae、节细菌属（（Arthrobacter）细菌是番茄幼苗期、花芽分化期及结果期植株根际土壤中共有的优势细菌属；而norank_f_norank_o_norank_c_KD4-96、norank_f_A4b和Bryobacter属细菌是幼苗期番茄植株根际土壤中的特有细菌属；TM7a和Saccharomonospora属细菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中的特有细菌属；Gemmatimonas属细菌为结果期番茄的特有细菌属。
由
图4 不同生育期番茄植株根际土壤细菌的LEfSe分析结果（LDA阈值为3.0）
Fig. 4 LEfSe analysis of rhizospheric soil bacteria of tomatoes under different growth stages （LDA score： 3.0）
由
图5 不同生育期番茄植株根际土壤真菌OTU水平的Chao指数（A）、Shannon指数（B）、Ace指数（C）、PCOA（D）和PLS-DA（E）分析
Fig. 5 The Chao index （A）， the Shannon index（B） ，Ace index（C）， PCoA（D） and PLS-DA（E） analyses of soil fungi in rhizospheres of tomatoes under different growth stages at OTU level
基于OTU分类水平的真菌PCoA分析结果显示，PC1轴和PC2轴的解释度分别为41.57%和27.14%；表明番茄幼苗期、花芽分化期和结果期植株根际土壤真菌群落结构存在显著差异（P<0.05），物种组成结构相似度低（
在属分类水平上，不同生育期番茄植株根际土壤中共有的优势真菌属数量为215个，幼苗期、花芽分化期及结果期番茄植株根际土壤中特有的优势真菌分别有61、31及54个（
图6 不同生育期番茄植株根际土壤真菌属（A）和OTU（B）分类水平Venn图
Fig. 6 Venn diagram of soil fungi in rhizospheres of tomatoes under different growth stages at genus（A） and OTU（B） levels
在OTU分类水平上，不同生育期番茄植株根际土壤中，共有优势真菌OTU数量为555个；幼苗期、花芽分化期和结果期特有的优势真菌分别有400、233和321个（
以上结果表明，无论是属或OTU分类水平，均以幼苗期番茄根际土壤中，特有的优势真菌数量为最高，依次分别为结果期和花芽分化期。
1）门分类水平。由
图 7 番茄不同生育期根际土壤真菌门（A）和属（B）分类水平相对占比
Fig. 7 Proportion of soil fungal phylum （A） and genus levels（B） in rhizospheres of tomato under different growth stages
幼苗期番茄植株根际土壤中，优势真菌门相对丰度占比大小顺序依次为：子囊菌门（Ascomycota，58.88%）、鞭毛菌门（Mortierellomycota，22.14%）、壶菌门（Chytridiomycota，7.76%）、unclassified_k_Fungi（5.61%）、担子菌门（Basidiomycota，3.64%）、罗兹菌门（Rozellomycota，1.35%）。
花芽分化期番茄植株根际土壤中，优势真菌门相对丰度占比大小顺序依次为：子囊菌门（Ascomycota，47.15%）、鞭毛菌门（Mortierellomycota，14.51%）、油壶菌门（Olpidiomycota，12.04%）、unclassified_k_Fungi（9.04%）、壶菌门（Chytridiomycota，8.86%）、担子菌门（Basidiomycota，4.92%）、罗兹菌门（Rozellomycota，3.26%）。
结果期番茄植株根际土壤中，优势真菌门相对丰度占比大小顺序依次为：子囊菌门（Ascomycota，52.12%）、unclassified_k_Fungi（14.71%）、油壶菌门（Olpidiomycota，11.15%）、鞭毛菌门（Mortierellomycota，8.10%）、担子菌门（Basidiomycota，6.11%）、壶菌门（Chytridiomycota，4.14%）、罗兹菌门（Rozellomycota，3.00%）。
上述结果表明，门分类水平下，虽然不同生育期番茄植株根际土壤中优势真菌群落组成相似，但不同优势细菌门类的相对丰度占比发生了显著变化。其中，鞭毛菌门真菌在番茄结果期中的丰度占比排序发生明显变化，均由幼苗期和花芽分化期的第2位下降至第4位；而油壶菌门真菌仅在幼苗期缺失。
3）属分类水平。由
幼苗期番茄植株根际土壤中，优势真菌属相对丰度占比由高到低排序分别为：被孢霉属（Mortierella，21.93%）、Ramophialophora（8.28%）、unclassified_k_Fungi（5.61%）、赤霉菌属（Gibberella，5.39%）、毛壳菌属（Chaetomium，5.23%）、新赤壳属（Neocosmospora，4.92%）、unclassified_p_Chytridiomycota（4.46%）、unclassified_f_Cucurbitariaceae（3.52%）、弯孢属（Curvularia，3.47%）、曲霉菌属（Aspergillus，2.46%）、unclassified_o_Pleosporales（2.37%）、unclassified_c_Sordariomycetes（1.78%）、篮状菌属（Talaromyces，1.70%）、鲍尔壶菌属（Powellomyces，1.55%）、unclassified_p_Ascomycota（1.54%）、Saitozyma（1.42%）、镰刀菌属（Fusarium，1.52%）和其他（19.77%）。
花芽分化期番茄植株根际土壤中，优势真菌属相对丰度占比由高到低排序为：被孢霉属（Mortierella，14.50%）、油壶菌属（Olpidium，12.04%）、Ramophialophora（11.31%）、unclassified_k_Fungi（9.04%）、unclassified_p_Chytridiomycota（6.01%）、赤霉菌属（Gibberella，4.95%）、新赤壳属（Neocosmospora，3.41%）、弯孢属（Curvularia，2.81%）、unclassified_p_Rozellomycota（2.68%）、unclassified_f_Chytridiaceae（2.12%）、柄孢壳属（Zopfiella，1.90%）、毛壳菌属（Chaetomium，1.83%）、unclassified_o_Pleosporales（1.81%）、unclassified_f_Cucurbitariaceae（1.80%）、unclassified_p_Ascomycota（1.61%）、unclassified_c_Sordariomycetes（1.52%）、Saitozyma（1.45%）、Apiotrichum（1.38%）、篮状菌属（Talaromyces，1.21%）、镰刀菌属（Fusarium，1.08%）、曲霉菌属（Aspergillus，1.03%）和其他（14.42%）。
结果期番茄植株根际土壤中，优势真菌属相对丰度占比由高到低排序为：unclassified_k_Fungi（14.71%）、Ramophialophora（13.10%）、unclassified_p_Chytridiomycota（10.10%）、被孢霉属（Mortierella，8.09%）、unclassified_p_Rozellomycota（5.43%）、赤霉菌属（Gibberella，5.28%）、新赤壳属（Neocosmospora，3.49%）、油壶菌属（Olpidium，3.00%）、弯孢属（Curvularia，2.79%）、unclassified_o_Pleosporales（2.55%）、链格孢属（Alternaria，2.07%）、毛壳菌属（Chaetomium，1.96%）、unclassified_c_Sordariomycetes（1.84%）、镰刀菌属（Fusarium，1.61%）、曲霉菌属（Aspergillus，1.36%）、unclassified_p_Ascomycota（1.32%）、柄孢壳属（Zopfiella，1.14%）、篮状菌属（Talaromyces，1.00%）和其他（16.93%）。
综上，不同生育期番茄植株根际土壤中，被孢霉属（Mortierella）、Ramophialophora、unclassified_k_Fungi、unclassified_p_Chytridiomycota、赤霉菌属（Gibberella）、新赤壳属（Neocosmospora）、弯孢属（Curvularia）、毛壳菌属（Chaetomium）、unclassified_o_Pleosporales、unclassified_c_Sordariomycetes、曲霉菌属（Aspergillus）、unclassified_p_Ascomycota、镰刀菌属（Fusarium）、篮状菌属（Talaromyces）真菌是幼苗期、花芽分化期及结果期番茄植株根际土壤中共有的优势真菌属；鲍尔壶菌属（Powellomyces）真菌是幼苗期番茄植株根际土壤中的特有真菌属；Apiotrichum和unclassified_f_Chytridiaceae真菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中的特有真菌属；链格孢属（Alternaria）真菌为结果期番茄的特有真菌属。
由
Fig. 8 LEfSe analysis of soil fungi in rhizospheres of tomatoes under different growth stages （LDA score： 3.0）
被孢霉属（Mortierella）、曲霉菌属（Aspergillus）、顶多毛孢属（Bartalinia）和鲍尔壶菌属（Powellomyces）真菌是幼苗期番茄植株根际土壤中具有显著优势的真菌属。unclassified_f_Chytridiaceae、油壶菌属（Olpidium）和柄孢壳属（Zopfiella）真菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中具有显著优势的真菌属。Dokmaia，、unclassified_k_Fungi、unclassified_p_Rozellomycota、链格孢属（Alternaria）真菌是结果期番茄植株根际土壤中具有显著优势的真菌属。
土壤酶、微生物生物量与土壤养分密切相
根际微生物群落组成多样性和功能多样性对于维持土壤微生态的平衡发挥着重要作用，而植物不同生育期的根际微生物种类及丰度具有显著差异。土壤中的根际微生物与植物之间相互作用，微生物通过产生植物激素，直接或间接影响植物生
此外，酸杆菌门（Acidobacteriota）细菌与氮循环紧密相
本研究发现，酸杆菌门（Acidobacteriota）和绿弯菌门（Chloroflexi）细菌是幼苗期番茄植株根际土壤的优势细菌门类；而鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）和节细菌属（Arthrobacter）细菌是幼苗期番茄植株根际土壤中的优势菌属；德沃斯氏菌属（Devosia）、糖单孢菌属Saccharomonospora和Microvirga细菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中的优势细菌属；拟杆菌门（Bacteroidota）、芽单胞菌门（Gemmatimonadota）和黏菌门（Myxococcota），以及Gemmatimonas属细菌是结果期番茄植株根际土壤中的优势细菌门属。
另一方面，被孢霉菌属（Mortierella）真菌可以改善土壤养分状况，保护植物根系，促进植物生长与提高抗逆能力，并可以提高土壤磷的可利用
本研究发现，被孢霉菌属（Mortierella）、毛壳霉（Chaetomium）属和曲霉菌属（Aspergillus）真菌是幼苗期番茄根际土壤中的优势真菌属；油壶菌属（Olpidium）真菌则是花芽分化期番茄根际土壤中的优势真菌属；链格孢属（Alternaria）真菌和镰刀菌属（Fusarium）真菌是结果期番茄根际土壤中的优势真菌属。结果表明，不同生育期番茄植株根际土壤中虽然富集了部分共有的微生物属，但同时亦富集了种类与功能相异的微生物。其中，幼苗期番茄植株根际土壤中，主要富集了大量可产生生长素、细胞分裂素和赤霉素的微生物类群；花芽分化期番茄植株根际土壤中，则主要富集了具有抗逆功能的微生物类群；结果期番茄植株根际土壤中，主要富集了具有促进养分循环功能的微生物。norank_f_norank_o_norank_c_KD4-96，norank_f_A4b和Bryobacter属细菌和鲍尔壶菌属（Powellomyces）属真菌是幼苗期番茄植株根际土壤为特有的优势微生物类群；其中TM7a和Saccharomonospora属细菌和Apiotrichum和unclassified_f_Chytridiaceae真菌是花芽分化期番茄植株根际土壤中特有的优势微生物类群；Gemmatimonas属细菌和链格孢属（Alternaria）真菌是结果期番茄植株根际土壤中特有的优势微生物类群。
参考文献 References
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