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基于统计纹理残差学习网络的葡萄叶片分类方法  PDF

  • 唐恒翱 1
  • 李杭昊 1
  • 孙志同 1
  • 孟江飞 2
  • 杨博宇 1
  • 张宏鸣 1
1. 西北农林科技大学信息工程学院,杨凌 712100; 2. 西北农林科技大学葡萄酒学院,杨凌 712100

中图分类号: TP391.4

最近更新:2023-06-16

DOI:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2023.03.020

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摘要

针对葡萄叶片类间相似度高导致的类内品种分类精度低的问题,构建一种改进的统计纹理残差学习网络(statistical texture residual learning network, STRLNet)的葡萄叶片分类方法。首先在ResNet50骨干网络的基础上添加SE注意力机制,然后构建底层信息的特征增强层,最后将增强后的底层特征与骨干网络提取的高层语义信息相融合,输出连接到用于存储分类特性的全连接层上。利用采集的11种成熟期葡萄叶片数据集进行训练测试,结果显示,STRLNet在提高网络空间性能的同时可充分利用底层特征信息,对构建的葡萄叶片数据集的分类准确率可以达到92.26%,相较于ResNet骨干网络提高了约2.8个百分点,与VGG16、Inception v4和ResNet等主流分类网络相比在葡萄叶片细粒度分类中具有更高的准确性。研究结果表明,在多品种的葡萄叶片分类任务中,改进后的模型相较于骨干网络可以关注到更多的特征信息,相较于主流分类网络模型可以获得更高的分类精度,模型性能得到进一步的提升。

葡萄是世界上最有价值的园艺作物之一,联合国粮食及农业组织的统计数据库(https://www.fao.org/faostat/zh/#data)显示,2020年全球葡萄产量为7 803万t,其中我国是全球第二大葡萄生产国。不同品种的葡萄价值差异很大,同时也影响到所酿葡萄酒的品质。移植的葡萄幼苗需要2~3 a才能结果,但是其叶子却可以在几个月内成熟。因此,通过叶片实现早期品种鉴定可以排除误种情况、保护育种者的权益、促进葡萄产业健康发展。同时葡萄品种识别对葡萄资源统计、新品种鉴定及葡萄遗传资源保护都有重要意

1-2

目前,基于叶片的常用分类方法有2种:基于图像特征分析和基于深度学习。图像特征分析方法通常使用数学模型和图像处理技术来分析特征,从图像中提取有用的信息。现有研究以叶片形状作为主要提取特

3-5,但由于植物叶片形状的复杂多样性以及很多同类叶片存在较大的差异性,而不同类叶片又存在极大相似性,使得很多单一使用形状特征分类的方法实际识别精度不高。近年来,研究者尝试将叶片形状特征与纹理特征相结合以获得更高的识别6-7,虽然在某些场景下取得了不错的准确率,但是这些方法仍然存在一些问题,如在特征的选择和定义上很大程度依赖算法设计人员的判断和长时间调试的误差处理,专业性要求高且难以捕获高级语义特征。而深度学习通过神经网络自动提取特征,充分利用深度卷积网络中的高层语义信息,具有简单、高效等优8。当前主要利用深度卷积网络对不同种类的叶片进行分9-11。虽然可获得不错的分类准确率,但研究对象主要针对形状差异较大的不同种类叶片,在解决同种类的细粒度分类问题上仍具有挑战性。Yang12基于VGG16、Inception v3和Nasnet这3种CNN融合的模型来识别3种外观高度相似的肉桂叶片。Peng13提出使用迁移学习的MobilNet v2、ResNet50作为主干网络对叶片进行分类。Li14利用金字塔结构构造3个并行的主干分类网络,并利用特征融合和添加注意力机制的方法引导模型关注重要的特征区域。与图像分析方法相比,基于深度学习的方法可以自动提取特征并且充分利用深度卷积网络中的高层语义信息,因此更适合应用于图像分类。但是大部分分类、分割网络主要关注于利用深度卷积网络中的高层语义信息,会导致输出结果的不准确性,并且漏检了一些很关键的低层细节,如边缘、纹理、形状信息。

为进一步改进葡萄叶片识别模型,本研究提出一种充分利用底层特征的新残差学习网络,构建底层信息的特征增强层,同时添加SE注意力机制,通过融合操作,将底层信息与高层信息结合起来,并利用构建的11个葡萄品种的数据集对模型进行评价,旨在构建一套高精度的细粒度识别模型,实现不同葡萄品种的精准分类,为农业、葡萄酒行业提供技术参考。

1 材料与方法

1.1 葡萄叶片数据集

建立一个包含11个葡萄品种的成熟叶片数据集。这些图像采集自西北农林科技大学的葡萄种植园,每类葡萄叶采集50~120片,将叶片带回实验室后,使用固定的拍摄台进行拍摄,以确保图像中的叶片相对大小一致,每张图像的分辨率为3 000像素×3 000像素,拍摄物距约0.3 m。所有叶片的正面和背面均被采集,经过筛选去除叶片区域不完整的数据后,共留下873张叶片图像作为基础数据集。阳光玫瑰、户太八号、瑞都红玉、魏可、赤霞珠、甜蜜蓝宝石、霞多丽、爱隔丽、媚丽、意大利、克伦生无核样本数分别为52、72、106、86、99、38、74、94、90、84、78张。对每幅实验图像按照类别对应的编码(1~11)进行类别的标注,获得11种不同标签值的数据集图像,在网络学习训练过程中,按照整片树叶进行学习。葡萄叶片品种的图像如图1所示。

图1  11个葡萄品种叶片样品

Fig. 1  11 cultivars of grape leaves used in the experiment

A:阳光玫瑰 Shine-Muscat; B:户太八号Hutai 8; C:瑞都红玉 Ruiduhongyu; D:魏可 Wink; E:赤霞珠 Cabernet Sauvignon;F:甜蜜蓝宝石 Moon Drops; G:霞多丽 Chardonnay;H:爱隔丽 Ecolly; I:媚丽 Meili;J:意大利 Italia; K:克伦生无核 Crimson Seedless.每个分图里左侧为叶片正面,右侧为叶片背面。In each drawing, the left side is the front side of the blade, and the right side is the back side of the blade.

1.2 数据集的构建

采用双线性插值

15将原始图像的分辨率降低到224像素×224像素。图像通过利用多种数据增强方法对原始数据集进行增强。增强方法为旋转90°、水平翻转、垂直翻转、随机调整亮度增强对比度、色调和饱和度,有助于降低过拟合风险,提高分类器的泛化能力,从而提高模型的鲁棒性。增强后数据集共有4 365张图片,在增强过程中对数据集进行样本均衡处理,每个类别约400张图片,其中80%的叶片图像作为训练数据集,20%作为测试数据集。训练集中20%的数据随机作为验证集,测试数据集仅用于评估分类器的性能。

1.3 模型设计

以分类领域中广泛应用且表现良好的ResNet50结构作为骨干网络。该网络主要由49个卷积层和1个最大池化层组成。在ResNet50的卷积模块中通过添加SE注意力机

16,以提高网络的空间性能,ResNet50se结构图如图2所示。

图2  ResNet50se内部结构

Fig.2  ResNet50se internal structure

葡萄叶的形状和纹理特征在葡萄分类中起重要作

17。成龄葡萄叶片的形状,上下裂刻有无、裂刻的深度、裂刻的数量,叶柄洼开叠类型,叶片基部形状,叶顶端形状,叶顶端长短等用来作为区别葡萄不同品种的依18。浅层过滤器擅长于提取这些局部纹理特征,因此,本研究提出一种充分利用底层纹理特征的新的统计纹理残差学习网络(statistical texture residual learning network, STRLNet)。将图像输入到网络ResNet50se中,提取高层特征和底层特征,然后对高层特征与底层特征进行融合操作,对融合的特征信息进行处理,实现最后的分类。但从主干网络的浅层中提取的低层次的特征,往往质量较低,特别是对比度较低,导致纹理细节模糊,对低层次信息的提取和利用产生负面的影响。通过构建纹理增强模块(texture enhancement module, TEM19来增强底层特征的纹理细节,从而更容易捕获底层特征信息。

模型结构如图3所示,图像首先输入到网络ResNet50se中,将经过Layer 1后提取的低级特征(shallow layer features, SLF)送入TEM模块中进行底层特征增强操作。然后将输出结果与SLF进行连接操作,最后再与经过ResNet50se得到的高级特征进行融合。特征融合后将输出连接到一个Dropout层和用于储存分类特征的11节点全连接层,构建统计纹理残差学习网络。

图3  统计纹理残差学习网络结构

Fig.3  Statistical texture residual learning network

1.4 实验环境及模型精度评价方法

所使用的硬件平台为Intel(R) Xeon(R) Silver 4116 CPU @ 2.10GHz,进行模型测试的CPU为NVIDIA TESLA V100 16 GB。所有实验使用Python3.8.5在TensorFlow2.2.0深度学习框架下实现。经过测试,超参数设置如下:优化器为随机梯度下降法,实验室数据集训练批次设置为64,学习率为10-3,学习率衰减系数为10-6,训练轮次最大值设置为300。设置早停机制,当验证集的损失在50轮次中变化小于0.1即停止训练。采用5倍交叉验证法计算模型的平均精度,基于混淆矩阵计算各种指标,包括精度、召回率和F1分数,以评估模型的性能和总体分类精

20

对于图像分类问题,预测的结果一般有4种情况:真正例(true positive, TP)、真负例(true negative, TN)、假正例(false positive, FP),假负例(false negative, FN)。其中,TP为每个类别中正确分类的叶片图像数量,即预测为正,实际也为正;而TN则表示除相关类别之外的所有其他类别中正确分类的图像的总和,即预测为负,实际也为负;FN给出了相关类别中错误分类的图像的数量,即预测为负,实际为正;FP给出了除相关类别之外的所有其他类别中错误分类的图像数量,即预测为正,实际为负。

所用的基本评价指标有准确率(accuracy,A)、精确率(precision,P)、召回率(recall,R)和F1分数(F1-score)。A代表分类正确的样本占整体样本的比例,用来评估模型的好坏。P是针对预测结果而言的,其含义是在所有预测为正的样本中实际为正样本的概率。R是针对原样本而言的,表示在实际为正的样本中被预测为正样本的概率。F1-score是PR的调和平均数,是对这2项指标的综合考虑。这些指标的计算公式如下:

A=TP+TNTP+FP+FN+TN (1)
P=TPTP+FP (2)
R=TPTP+FN (3)
F1-score=2×P×RP+R (4)

2 结果与分析

2.1 主干网络的选择

在主干网络选择中,对常见的和高性能的分类模型进行测试,以找到一个适合对葡萄叶片进行分类的主干网络模型。这些模型用统一的超参数,当验证集损失稳定时停止训练。然后使用验证集损失值最低的模型在测试集进行准确率计算。测试结果显示,模型VGG16、Inceptionv4、ResNet34、ResNet101、ResNet50在葡萄叶片数据集分类的准确率分别为72.62%、86.23%、86.68%、88.47%、90.12%。测试结果表明,ResNet50和ResNet101在自建葡萄叶片数据集下表现最好,ResNet50作为平均准确率最高的模型,需要的计算资源较少,因此,更适合葡萄叶片细粒度分类场景。

2.2 叶片数据集的选择

在采集到的葡萄叶片数据集的基础上,对叶片正面、背面图像分类精度进行实验测试,以测试叶片正反面对分类精度的影响。分别选择正面叶片、背面叶片以及每张叶片正反两面3种数据集进行模型的训练并以对应的测试集进行分类准确率的比较,叶片正面图像数据集、叶片反面图像数据集和叶片正反两面数据集的分类精度分别为92.34%、93.08%、92.96%。根据计算结果可知,正反叶面图像在分类精度上相近,考虑到对整体叶片进行充分学习,选择叶片正反两面图像作为训练数据集。

2.3 消融实验

为验证所提出的以ResNet50为骨干网络的改进策略对分类性能的影响,在数据集上展开消融实验,以对比细粒度分类模型不同结构的模型性能。选择分类精度可以达到约90.12%的ResNet50作为基础网络,首先在ResNet50基础上增加了SE注意力机制,得到的ResNet50se模型相较ResNet50在分类能力上具有小幅提升,精确度达到90.25%。其次,简单地将主干网络ResNet50se的Layer 1输出的浅层特征SLF与基础网络的最终输出连接起来,修改后可将性能小幅提升至91.12%左右。最后,在SLF之后插入TEM模块,进一步将分类精度提高到92.96%。

2.4 热力图对比

为分析模型在分类层前的高维特征,即最后1层卷积的关注焦点,使用Grad-CAM

21热力图确定模型的关注区域,如图4所示,较亮的区域表明模型对这些区域的关注程度更高。可见ResNet50主干网络已具有一定的分类性能,关注的区域主要集中在叶片的右侧部位,而结合底层特征与高层特征融合后的STRLNet模型(ResNet50se+SLF+TEM)的关注度更均匀地集中在葡萄叶片边缘和中心区域,尤其对中心叶脉处给予了很高的关注度。

图4  主干分类器和STRLNet分类器的Grad-CAM图对比

Fig.4  Grad-CAM of the backbone and the STRLNet classifiers

A:ResNet50分类网络对赤霞珠叶片特征提取的Grad-CAM图;B:STRLNet分类器对相同叶片的Grad-CAM对比图。高亮区域为重点关注区域。A: Grad-CAM map of Cabernet Sauvignon leaf features extracted by ResNet50 classification network; B: Grad-CAM map of STRLNet classifier for the same leaf. The highlighted area as the focused area.

2.5 分类模型的性能评价

模型在训练过程中对11个葡萄品种叶片分类的准确性如表1所示,对应的混淆矩阵如图5所示。

表1  11个葡萄品种叶片分类的准确性
Table 1  Accuracy of the classification of grape leaves for the 11 cultivars with Pyramid TriResNet50se ( % )
编号Number品种名Cultivar精确率 Precision

召回率

Recall

F1-分数

F1-score

1 阳光玫瑰Shine⁃Musca 100 100 100
2 户太八号 Hutai 8 92.53 86.11 89.20
3

瑞都红玉

Ruiduhongyu

96.03 91.50 93.71
4 魏可 Wink 94.87 87.05 90.79
5

赤霞珠

Cabernet Sauvignon

100 100 100
6

甜蜜蓝宝石

Moon Drops

78.57 86.84 82.50
7 霞多丽 Chardonnay 98.64 98.64 98.64
8 爱格丽 Ecolly 98.93 97.89 98.41
9 媚丽 Meili 86.86 95.55 91.00
10 意大利 Italia 99.23 96.26 97.72
11

克伦生无核

Crimson Seedless

88.50 98.71 93.33

图5  葡萄叶片数据集的统计纹理残差学习网络的混淆矩阵

Fig.5  Confusion matrix of the statistical texture residual learning network for the grape leaf dataset

根据混淆矩阵结合数据集进行分析,品种3“瑞都红玉”与品种4“魏可”、品种6“甜蜜蓝宝石”、品种2“户太八号”与品种9“媚丽”的叶片特征相似,模型易出现相互干扰的情况。品种4中有叶片图像被误分类为品种3,但是品种3却并没有出现误分类为品种4的情况,说明品种4所提取到的分类特征与其他品种特征相比并无明显差异,易被其他品种干扰。从图6中品种3、品种4的热力图可见,STRLNet分类器对品种4的热力图仅关注到了叶片上部的区域,该部位与一些品种相比具有一定的相似性,容易出现误分情况产生。而品种3进行分类学习中关注的区域较多,既有对叶顶端的关注,也有对裂刻与叶柄洼区域的关注,所以并不易错分为品种4。品种5“赤霞珠”与其他种类叶片相比,在叶片形态和裂刻数量上具有明显差异,品种1“阳光玫瑰”在叶基部及叶裂刻形状上具有区分度,因此具有极高的分类精度。

图6  STRLNet分类器在不同品种的Grad-CAM图

Fig.6  STRLNet classifer Grad-CAM plots of classifiers in different varieties

A:阳光玫瑰 Shine⁃Musca; B:瑞都红玉 Ruiduhongyu; C:赤霞珠 Cabernet Sauvignon; D:魏可 Wink。从左到右分别为原图、Grad-CAM热力图和原图与热力图的结合图。Figures from left to right are the original map, Grad-CAM heat map and the combined map,respectively.

3 讨论

由于在叶片图像的采集过程中,会出现重叠或者边缘区域不完整等情况,因此,仅使用叶片图像对葡萄品种进行细粒度分类存在一定的局限性,这部分容易错误分类的图像给所有的分类模型都带来了困难。同时,STRLNet分类器是在ResNet50骨干网络基础上增加了分支模块,所以运行所需要的显存空间比单一网络大。但是相较于ResNet50骨干网络,改进后的分类器关注度更均匀地集中在葡萄叶片边缘和中心区域,尤其对中心叶脉处的关注度很高,增强了对特征信息的提取。改进后的网络模型在葡萄叶片数据集上的精确率可以达到92.96%,相较ResNet骨干网络的提高了约2.8个百分点。

对比Yousefi

22提出的多层感知叶片分类器和Xue23基于叶片的可见光/近红外光谱参数作为输入构建的人工神经网络,STRLNet属于端到端的网络结构,不用花费大部分时间设计分析特征,特征提取不依赖于算法设计人员的判断,同时也不需要长时间人工调试处理误差。与郑一力11提出的基于AlexNet、Inception v3模型的卷积神经网络植物叶片图像识别方法、Peng13提出的使用迁移学习的MobilNet v2、ResNet50叶片分类模型进行横向对比,STRLNet在准确性、损失率等指标明显优于其他模型,说明改进模型的识别准确度较高,模型性能得到进一步提升。结果表明,STRLNet模型在葡萄叶片分类场景下精确率最高,对叶片特征提取更加丰富,尤其对比Yang12提出的基于VGG16、Inception v3和Nasnet这3种CNN融合的模型分类模型提升效果明显,在葡萄叶片细粒度分类中具有更高的精确率。根据整体指标来看,统计纹理残差学习网络可以在不需要人工干预的情况下,根据叶片图像的形状、大小、颜色和纹理提取特征信息,实现较为精准的细粒度分类。

本研究构建的基于叶片的葡萄品种分类模型,有助于快速区分不同葡萄品种;结合叶片的形态学特征创新分类方法,可以帮助研究者更好地认识葡萄叶片、区分葡萄品种。通过农业图像分类数据集PlantVillage

24评估STRLNet分类器对14种不同种类植物的分类能力,结果表明,STRLNet分类器不仅适用于葡萄品种鉴定,而且对其他作物的分类和识别也能获得不错的效果,是一种通用的分类器,可应用于农业图像分类和细粒度分类等其他问题,可为植物的品种分类提供参考。

因为不同品种叶片相似度较高,所以目前分类结果中仍存在一些错误分类的情况。从Grad-CAM热力图可以看出, STRLNet并不能充分提取所有种类的特征信息,例如品种4魏可。在今后的研究中,可尝试先对原始图像数据集通过图像分割处理提取图像边缘、纹理信息,再通过连接特征图进行特征融合,以增加特征信息的提取,进一步提高分类的精确性。

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