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团头鲂cdc20基因的序列特征和表达分析  PDF

  • 庞连慧 1
  • 罗双双 1
  • 石林林 1
  • 陈天圣 2
  • 刘红 1
  • 王焕岭 1
1. 华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室,武汉 430070; 2. 集美大学水产学院/农业农村部东海海水健康养殖重点实验室,厦门 361021

中图分类号: S917.4

最近更新:2022-10-12

DOI:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2022.04.028

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摘要

为研究鱼类细胞分裂周期蛋白20基因(cell division cycle 20 homolog,cdc20)的功能,以团头鲂为试验对象,经PCR扩增获得了团头鲂cdc20基因的CDS,基于多序列比对和系统进化树分析该基因的结构和不同物种间的进化关系,采用半定量PCR(semi-quantitative reverse transcription PCR,sqRT-PCR)、荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和切片原位杂交的方法检测了该基因的时空表达模式。结果显示,该基因编码区所包含的序列长度为1 482 bp,编码493 aa。团头鲂Cdc20氨基酸序列在进化上十分保守,具有7个WD40基序形成的稳定7叶β螺旋桨状结构,与鲤和斑马鱼的相似性最高。qRT-PCR结果显示团头鲂cdc20基因在早期胚胎中的表达量最高,随后呈下降趋势。sqRT-PCR检测发现cdc20基因主要在性腺中表达。性腺切片原位杂交结果显示cdc20在团头鲂各时期卵母细胞中均有表达,主要集中在Ⅱ期卵母细胞的胞质和Ⅲ、Ⅵ期卵母细胞的卵黄颗粒中;另外也发现该基因在精巢的精原细胞和生精小管的生殖上皮中表达量最高,在精子中的表达较低。以上结果表明团头鲂cdc20基因是一个母源基因,可能参与生殖细胞的发育。

鱼类性腺成熟是生殖细胞不断增殖、分化成成熟配子的过程,而配子的成熟需要经过2次减数分裂,其中涉及了同源染色体的配对、联会、重组和分离等,其中任何环节的异常都会导致减数分裂过程无法正常进行,进而导致配子发育的异

1,因此,这个过程需要精确而复杂的分子调控。细胞分裂周期蛋白20(cell division cycle 20 homolog,CDC20)是细胞周期、有丝分裂和减数分裂的重要调节因2。据报道,不同物种CDC20蛋白的结构域十分保守,一般含有7个WD40基序形成稳定的7叶螺旋桨状结构,作为支架介导泛素结合酶与底物之间相互结3。在卵母细胞减数分裂中,CDC20蛋白是同源染色体分离的关键因子,通过影响减数分裂的重要调控蛋白——后期促进复合物(anaphase promoting complex/cyclosome,APC/C)的活性促进Ⅱ期姐妹染色体分离。研究发现CDC20蛋白表达量降低会导致小鼠受精卵几乎不能正常发4,而其蛋白失活会引起胚胎死5。在人类中,CDC20基因的突变导致女性不6和男性的生殖能力降7。这些研究表明CDC20在动物生殖、胚胎发育中发挥重要作用。目前,CDC20的功能研究在鱼类中尚未涉及。因此,为了解鱼类cdc20基因的功能,本研究以团头鲂为试验对象,对其cdc20基因的序列特征、系统进化和时空表达模式进行初步研究,旨在为后续的基因功能研究奠定基础。

1 材料与方法

1.1 团头鲂总RNA的提取与cDNA合成

使用TRIzol(康为世纪生物科技股份有限公司)提取团头鲂成鱼不同组织的总RNA,包括脑、眼睛、鳃、心脏、肝脏、脾脏、肠、肾脏、卵巢、精巢和肌肉。采集不同发育时期(受精卵、2-细胞期、16-细胞期、囊胚期、原肠期、神经期、体节期、心跳期和孵化期)的胚胎并提取总RNA。将提取的总RNA用PrimeScript® RT reagent Kit With gDNA Eraser (TaKaRa)试剂盒进行反转录合成第一链cDNA。

1.2 团头鲂cdc20基因的克隆和进化分析

将斑马鱼的cdc20 cDNA序列(Accession: NM_213080)与笔者所在实验室的团头鲂转录组数据进行比对,获得团头鲂cdc20基因的编码区序列。并根据此序列使用Oligo 7和Beacon Designer 7软件设计PCR引物以扩增团头鲂cdc20基因的编码区序列。根据预测的氨基酸序列利用ClutsalX软件进行多序列比对以及使用SWISS在线网站(https://swissmodel.expasy.org/)预测蛋白结构域;基于MEGA 6.0软件的Neighbor-joining方法构建进化树。

1.3 sqRT-PCR

采用sqRT-PCR方法检测cdc20基因在团头鲂成鱼各组织中的表达模式,以β-actin作为内参基因,引物序列见表1。PCR条件如下:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 10 s,30个循环;72 ℃ 5 min。PCR扩增结束后,取10 µL PCR产物,使用1%的琼脂糖凝胶,140 V电压下电泳15 min,检测该基因在各组织中的表达量。

表1  本研究所用引物
Table 1  All primers used in this study

引物名称

Primer names

引物序列(5′-3′) Primer sequences(5′-3′)用途 Usage
cdc20 ORF-F TGCATCAGAGGAACGAAGTTG ORF扩增 Amplification of ORF
cdc20 ORF-R AAACCTCCCAACTCCCTGTTT
cdc20-QF TACAGCACCAAATCAGAAAGC 表达分析 Expression analysis
cdc20-QR TCTGCCTTCCCCAATCCATTA
cdc20-Probe-F TATCTGAACCTAATGGATTGG 合成cdc20探针 Synthesis of cdc20 probe
cdc20-Probe-R TAATACGACTCACTATAGGGGTCTGCTACTCTAACATCAT
β-actin-QF AAAATCAAGATCATCGCCCCAC 表达分析(内参基因) Expression analysis (internal gene)
β-actin-QR TACTCCTGCTTGCTAATCCAC

1.4 qRT-PCR

使用SYBR ® Green qPCR Mix试剂盒,在CFX96 Real-Time PCR Dectection System中进行qRT-PCR。每个样品3次重复,以β-actin作为内参基因。以团头鲂不同发育时期胚胎的cDNA为模板,参照下列反应体系进行PCR扩增:模板cDNA 1 µL,正向引物和反向引物各0.4 µL;SYBR® Green qPCR Mix 10 µL,ddH2O 8.2 µL。反应条件为:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 10 s,39个循环;72 ℃ 5 min。结果通过2 -∆∆Ct法计算cdc20的相对表达量,数值用“平均值±标准差”(n=3)表示,用GraphPad Prism 8软件作图。采用单因素方差分析方法(ANOVA)和Duncan’s检测mRNA表达水平的差异,当P<0.05时,认为差异显著。

1.5 性腺组织切片H.E染色及观察

团头鲂的性腺组织用4% PFA(DEPC水处理)固定后送武汉赛维尔公司做切片,依次将切片进行如下操作:二甲苯洗2次,每次20 min;无水乙醇洗2次,每次10 min;95%乙醇5 min;90%乙醇5 min;80%乙醇5 min;70%乙醇5 min;蒸馏水冲洗后,苏木素染色3~8 min,自来水洗;1%的盐酸乙醇分化数秒,自来水冲洗;0.6%氨水返蓝,流水冲洗;伊红染液中染色1~3 min;将切片放入95%乙醇洗2次,每次5 min;无水乙醇洗2次,每次5 min;二甲苯洗2次,每次5 min,切片拿出来稍晾干,中性树胶封片。以上操作完成后于显微镜(Leica,DFC550)下观察。

1.6 切片原位杂交

以团头鲂cdc20 cDNA序列作为模板,设计探针引物(表1),在反向引物的5'端加上T7启动子序列,并参照下列反应体系进行体外转录:DNA模板1 µg,10×transcription buffer 2 µL,T7/SP6 RNA 聚合酶2 µL,DIG-NTP Mix 2 µL,RNase Inhibitor 1 µL,RNase-free水加至20 µL;体系混匀后,37 ℃水浴4 h后完成体外转录,合成的探针大小为342 bp。利用石蜡切片进行原位杂交,具体如下:二甲苯洗5次,每次5 min;二甲苯∶无水乙醇(体积比)=1∶1洗2次,每次3 min;无水乙醇洗2次,每次3 min;依次用95%、90%、85%、75%、50%乙醇各洗1次,每次3 min;85 ℃ DEPC水洗3 min;滴加65 ℃预热的预杂交液,预杂交1~2 h;然后将5 ng/µL探针滴加到组织块上,放入湿盒,65 ℃杂交过夜;用2×SSCT 65 ℃清洗切片2次,每次30 min;0.2×SSCT 65 ℃清洗切片15 min,50%甲酰胺/2×SSCT 65 ℃清洗切片2次,每次30 min;用5%的羊血清封闭1~2 h;二抗(Anti-Digoxigenin-AP)室温孵育1.5 h;滴加BCIP/NBT(1 mL平衡液加4.5 µL NBT和3.5 µL BCIP)染色;显色完成后置于显微镜下观察。

2 结果与分析

2.1 团头鲂cdc20基因的分子特征和进化分析

通过PCR测序及生物信息学分析证实团头鲂cdc20编码区的基因组长3 960 bp,包含10个外显子和9个内含子,cDNA长1 482 bp,编码493 aa;预测蛋白的理论分子质量为5.44 ku,等电点为7.68。氨基酸序列多重比对结果显示(图1),团头鲂Cdc20与鲤和斑马鱼的相似度分别高达95.74%和90.12%,与大鼠、人类和非洲爪蟾的相似度分别为59.96%、59.36%和63.58%。结构域分析显示Cdc20有7个WD40重复基序,且该基序在不同物种中都相对保守,进一步分析发现每个WD40基序形成4股反向平行β折叠,7个WD40基序构成稳定的7叶螺旋桨状结构(图2)。

图1  团头鲂Cdc20蛋白的多序列比对

Fig.1  Multiple sequence alignment of Cdc20 proteins of Megalobrama amblycephala

所有氨基酸一致用深蓝色表示,75%一致用浅蓝色表示;WD40重复序列区域用红色框标识。Identical amino acids are indicated in navy blue and 75% in light blue; the WD40 repeat domains are noted with red frames.

图2  团头鲂Cdc20蛋白预测的三级结构

Fig.2  Predicted structure model of M. amblycephala Cdc20 protein

①~⑦分别代表每个WD40基序形成的四股反向平行的β折叠结构。①~⑦ represents four-stranded antiparallel β-sheets folded by each WD40 motif.

基于多个物种Cdc20氨基酸序列的系统进化分析显示,团头鲂与鲤的系统进化关系最近,其次是斑马鱼。而亲缘关系较远的两栖类、鸟类和哺乳类形成一个独立分支(图3)。

图3  脊椎动物CDC20蛋白的系统进化树

Fig.3  Phylogenetic analysis of the protein sequences of CDC20 in vertebrates

2.2 团头鲂cdc20在成鱼各组织和胚胎发育各时期的表达

通过sqRT-PCR检测cdc20基因在团头鲂成鱼不同组织中的表达情况,结果如图4所示,cdc20 mRNA在脑、鳃、心脏、脾脏、肠道、肾脏和肌肉中有微弱的表达,而在卵巢和精巢中表达量最高,说明cdc20可能与团头鲂性腺发育有关。

图4  团头鲂cdc20基因在成鱼各组织中的表达

Fig.4  Expression of cdc20 gene in different tissues of M. amblycephala

M:Marker; Br:脑 Brain; E:眼睛 Eye; G:鳃 Gill,H:心脏 Heart; S:脾脏 Spleen; I:肠道 Intestine; K:肾脏 Kidney; O:卵巢 Ovary; T:精巢 Testis; Mu:肌肉 Muscle; C:空白对照 Control.

通过qRT-PCR检测cdc20在团头鲂各发育阶段胚胎中的表达情况,包括受精卵、2-细胞期、16-细胞期、囊胚期、原肠期、神经期、体节期、心跳期和孵化期。结果(图5)显示该基因在受精卵中的表达水平最高,随着胚胎发育的进行,其表达量呈逐渐下降的趋势,推测团头鲂cdc20可能是1个母源基因,对维持胚胎的早期发育具有重要作用。

图5  团头鲂cdc20基因在胚胎发育各时期中的表达

Fig.5  Expression of cdc20 gene at different embryonic development stages of M. amblycephala

柱上的不同字母表示差异显著,P<0.05。 Different letters mean significant differences,P<0.05.Z:受精卵时期 Zygote stage;2:2-细胞期2-cell stage;16:16-细胞期16-cell stage;Bl:囊胚期 Blastocyst stage;Ga:原肠期 Gastrula stage;N:神经期 Neural stage;So:体节期Somite stage;He:心跳期Heartbeat stage;Ha:孵化期Hatching stage.

2.3 团头鲂cdc20在生殖细胞中的表达模式

根据团头鲂性腺切片原位杂交的结果(图6),cdc20基因在Ⅰ期卵母细胞信号最弱。卵母细胞进入Ⅱ期后,其表达量开始升高,且在卵母细胞的胞质内表达,而在皮质泡和细胞核中几乎没有表达。而在Ⅲ期卵母细胞的卵黄颗粒中检测到了强烈的探针信号,但细胞核中信号较弱。Ⅳ期卵母细胞中充满了卵黄颗粒,观察不到细胞核和皮质泡,cdc20基因在Ⅳ期卵母细胞的卵黄颗粒中表达,而在放射带几乎不表达。与H.E染色(图7A)对比,基于精巢切片原位杂交的结果显示,在精原细胞以及生精小管的生殖上皮中该基因的表达量最高,而在成熟精子中的表达量低(图7B)。

图6  cdc20基因在团头鲂不同发育时期卵母细胞中的表达

Fig.6  Expression of cdc20 gene at differentdevelopment stages of M. amblycephala oocytes

A:团头鲂Ⅱ期卵巢,以Ⅰ期和Ⅱ期卵母细胞为主。B:团头鲂Ⅳ期卵巢,以Ⅳ期卵母细胞为主,同时含有少量Ⅲ期卵母细胞。①箭头表示皮质泡;②箭头表示细胞核;③箭头表示放射带。比例尺:100 μm。A: Stage Ⅱ ovary of M. amblycephala,mainly consisted of oocytes with stage Ⅰ and stage Ⅱ. B: Stage Ⅳ ovary of M. amblycephala,mainly consisted of oocytes with stage Ⅳ and several stage Ⅲ.① Arrow indicates cortical vesicles; ② Arrow indicates nuclei; ③ Arrow indicates radial band. Bar: 100 μm.

图7  团头鲂cdc20基因在精巢中的表达

Fig.7  Expression of cdc20 gene in testis of M. amblycephala

A:精巢H.E染色;B:精巢切片原位杂交。SG:精原细胞;SP:精子。红色箭头表示生殖上皮。比例尺:20 μm。A: HE staining of testis; B: In situ hybridization of testis.SG:Spermatogonia;SP:Sperm.The red arrow indicates the germinal epithelium.Bar: 20 μm.

3 讨论

CDC20蛋白通过C端的WD40结构域(即WD40基序)识别、激活和结合APC/C调节细胞分裂中姐妹染色体的分

8,被认为是生殖细胞成熟的重要调节因9,在生物体生长和生殖中发挥重要作用。WD40蛋白最早在牛的G蛋白β亚基中发10,该蛋白的7个WD40基序形成稳定的螺旋桨状结11,参与信号转导、染色质组装、凋亡、细胞周期调控等过12。本研究发现团头鲂Cdc20包含的7个WD40基序可形成7叶螺旋桨状结构,这种特殊的结构形成稳定的支架,为蛋白质的识别和组装提供位点,并增强蛋白之间的互12。氨基酸序列和结构域的保守性说明团头鲂cdc20基因可能与在小鼠、人类中的功能相类似,参与了细胞周期调控、有丝分裂和减数分裂的过程。

本研究还发现,团头鲂cdc20主要在性腺中表达。类似地,有研究发现cdc20基因在斑马鱼性腺中高表达,且对斑马鱼卵子和精子发生过程具有重要作

13。在其他物种中,该基因同样与生殖相关。小鼠CDC20蛋白表达量的降低导致雌性失去生殖能5,人类CDC20基因发生突变导致女性不6和男性无精子7。因此,我们推测团头鲂cdc20基因可能参与生殖和性腺发育。另外,本研究发现在卵巢成熟过程中,随着卵母细胞的发育,该基因的表达量逐渐升高,这与在猪卵母细胞中的表达一14。而精巢切片的原位杂交结果与卵巢相反,cdc20在精原细胞中的表达量最高,而在发育成熟的精子中表达量最低。这些研究结果说明,cdc20基因可能在团头鲂卵巢和精巢中发挥的功能不同,在卵巢中可能参与卵母细胞的成熟过程,而在精巢中对精原细胞早期的形成具有重要作用。

此外,团头鲂cdc20在胚胎发育早期大量表达,然后逐渐下降,因此推测该基因是一个母源基因,对早期胚胎发育具有重要意义,包括激活卵子、促进早期的卵裂、促进合子基因的表达

15。在秀丽隐杆线虫中的研究发现,CDC20蛋白与APC/C复合物结合后参与母源因子卵母细胞成熟蛋白(oocyte maturation proteins,OMA)介导的卵母细胞到早期胚胎发育的过16。此外,有文献报道APC/C复合物是一个母源因17,而APC/C复合物的激活需要CDC20蛋白,由此推测CDC20蛋白存在于胚胎发育的早期。这些结果说明团头鲂cdc20可能是1个母源基因。

综上,本研究克隆并分析了团头鲂cdc20基因的序列特征及其时空表达模式,结果可为后续深入研究该基因的功能奠定理论基础。

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