西藏自治区色季拉山高寒草甸牧草根腐线虫的鉴定
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广东省林业科技创新专项(2015KJCX045)


Identification of lesion nematode in alpine cold meadow of Color Gerahs Mountain,Tibet
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    摘要:

    在西藏自治区色季拉山高寒草甸土壤线虫群落调查期间,从高山嵩草(Kobresia pygmaea)根际土壤中分离得到一种根腐线虫。通过形态特征观察和分子序列比对,将其鉴定为刻痕短体线虫(Pratylenchus crenatus)。其主要特征:唇环3个,口针长15.6~16.2 μm,口针基部球前缘略凹,侧线6条,V值为82.5~83.2,尾圆柱形,末端环纹清晰。对该线虫rDNA的3个区段(18S部分序列、28S D2D3区和ITS区)进行特异性扩增和测序,分别得到902、774和1 013 bp的序列。将所获得的序列在GenBank数据库上进行BLAST比对,结果显示:此线虫群体与刻痕短体线虫群体的相似度分别为97.4%~99.8%、97.4%~97.8%和90.2%~99.8%。贝叶斯推断法构建的系统进化树显示:本研究的线虫群体与刻痕短体线虫聚为高度支持的分支,进一步确定此线虫群体为刻痕短体线虫。本研究获得刻痕短体线虫中国群体的分子数据。该刻痕短体线虫是西藏自治区的新纪录种。高山嵩草是刻痕短体线虫的新寄主。

    Abstract:

    Degenerated primers were designed according to the conserved regions of NBSLRR domain from known plant resistance genes. Then these primers were used for amplification of the NBSLRR analogs from Lycopersicon esculentum. Sequence analysis showed that 5 fragments contained the resistance gene analogs,two of which have the ORF region and conserved NBSLRR domain. F58 (MG860907) shared 94% identity with the resistance genes of Mi1, and F520 (MG860908) shared 96% identity with the resistance genes of Hero. The quantitative realtime PCR results showed that expression of F58 and F520 was changed after Meloidogyne incognita infection,suggesting that F58 and F520 might be related with nematode infection.

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引用本文

王宏洪,卓侃,薛会英.西藏自治区色季拉山高寒草甸牧草根腐线虫的鉴定[J].华中农业大学学报,2019,38(1):59-66

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  • 在线发布日期: 2019-01-03
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