杨树肉桂醇脱氢酶基因序列和表达模式分析及CAD4酶活性检测
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国家自然科学基金重点项目(NSF30630053) 、福建省科技计划重点项目(2010N0018)、北京林业大学新进教师科研启动基金项目(2010BLX03)和中国博士后科学基金项目(20090450015)


Sequences and expression pattern of cinnamyl alcohol dehydrogenase gene and over-expression and detection of CAD4 enzymatic activity of poplar in vitro
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    摘要:

    应用生物信息学方法从杨树基因组数据库中筛选出19个杨树肉桂醇脱氢酶基因,它们聚为3类。序列分析表明,杨树CAD基因家族主要通过全基因组加倍和串联复制的方式进行扩张。杨树和拟南芥CAD家族共6对旁系同源基因,在较强的净化选择压力下进化。19个基因在杨树不同组织中均有表达,表达量较高的是PoptrCAD17、PoptrCAD4、PoptrCAD10和PoptrCAD7,其他基因表达相对较少,相同亚类的CAD基因表达变化趋势接近。从毛白杨中克隆得到PoptrCAD4,体外表达的CAD4酶催化活性很强,具有明显的松柏醇底物偏好。

    Abstract:

    The 19 CAD genes of poplar screened by bioinformatics are clustered into 3 groups.Analysis of their sequences showed that the expansion of CAD gene family in Populus was resulted from a recent whole-genome doubling and tandem replication.There are 6 paralogs in CAD gene family of Populus and Arabidopsis evolved under the purifying selection.The 19 CAD genes are expressed in all tissues of Populus.PoptrCAD17,PoptrCAD4,PoptrCAD10 and PoptrCAD7 expressed highly while the other CAD genes expressed at a lower level.Expression of the CAD genes in the same group varied with the same trends.CAD gene cloned in this research was PoptrCAD4.The catalytic activity of the CAD enzyme over-expressed in vitro were high,with the substrate preference of sinapyl alcohol.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

任珊珊,赵艳玲,白 华,蒋湘宁,盖 颖.杨树肉桂醇脱氢酶基因序列和表达模式分析及CAD4酶活性检测[J].华中农业大学学报,2011,30(5):578-584

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  • 收稿日期:2011-05-26
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