Page 50 - 《华中农业大学学报(自然科学版)》2022年第6期
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44 华 中 农 业 大 学 学 报 第 41 卷
GTSAAGGARACSGG - 3'、 5'- AGTTCTGS‐ 多重比较(α=0.05)。采用 QIIME(Version 1.9.0)
GTRGGCTTSAG - 3'),nirK基因引物为:F1aCu_R3 软件估算 nirS、nirK 基因的 α-多样性,采用未加权
Cu(5' - TTAGCATGGAATAATRRAATAGGA - 的 UniFrac 距离来计算多样性 [19] 。采用非度量多
[15]
3'、5' - TCTGGACCTGGTGAGTTTCC - 3') 。 维度尺度分析(NMDS)可视化样本间群落结构的
扩增条件(PCR 仪:ABI GeneAmp® 9700 型)为 : 差异 [20] 。相似性分析(ANOSIM)被用来评估群落
95 ℃预变性 3 min;95 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s, 结构的相似性和差异性 [21] 。用群落 barplot分析图来
共 27个循环;然后在 72 ℃ 延伸 10 min;最后于 4 ℃保 表示不同样品间 nirS、nirK 基因的组成 [22] 。利用
存。PCR 反应体系为:5×TransStart FastPfu 缓冲液 Canoco 5.0(Microcoputer Power,Ithaca,NY,USA),
4 μL,2.5 mol/L dNTPs 2 μL,上游引物(5 μmol/L) 采用基于 Bray-Curtis 距离的冗余分析(RDA)来解释
0.8 μL,下游引物(5 μmol/L)0.8 μL,TransStart Fast‐ 环境因子对反硝化群落的影响。
Pfu DNA 聚合酶 0.4 μL,模板 DNA 10 ng,ddH 2 O 补 2 结果与分析
足至 20 μL,每个样本 3 个重复。利用 Illumina 公司
的 Illumina Miseq PE300 平台(上海美吉生物医药科 2.1 不同轮作休耕模式下土壤理化性质
技有限公司)进行测序。 如表 2 所示,土壤 pH、碱解氮、速效磷、速效钾、
1.6 数据分析 NO 3 -N 均为 A(CK)处理最低(P <0.05),且均为
-
根据条形码的精确匹配,对不同样品进行 nirS、 B、C 处理的养分指数较高。而全氮、有机质、NH 4 -
+
nirK基因配对端读码解复,与条形码序列出现 1个或 N 含量中,A(CK)、B 和 E 处理显著高于其他处理
多个错配,或至少出现 2个与引物序列错配的读数被 (P <0.05)。土壤化学性质均为 B、C 处理更有利于
丢弃 [16] 。然后利用 FLASH(fast length adjusting of 土壤肥力的增加,利于土壤氮含量的积累。在土壤
short reads)将得到的读数进行合并,合并后的读数 物理性质中,A(CK)处理的土壤容重显著高于其他
至少有 10 bp 的重叠区域 [17] 。删除长度超出预期 处 理(P<0.05),分 别 高 出 0.81%、0.76%、0.86%、
200~500 bp 的序列或含有任何模糊碱基的序列,获 0.90%。E 处理的土壤含水率显著高于其他处理,其
得的干净读取数分别为:421 362和232 177。经过筛 次是 A 处理,E 处理显著高出了 32.14%、101.86%、
选和嵌合体去除后,使用 UCLUST 以 97% 的序列同 83.58%、780.87%。E 处理能有效降低土壤容重,改
源性进行de novo操作分类单元(OTU)的筛选 [18] 。最 善土壤团粒结构,且保水性较好。结果表明,不同轮
后,分别获得nirS和nirK基因OTUs 1 642和1 653 。 作休耕模式均能改善土壤肥力和土壤结构,并抑制
采用 Microsoft Excel 2019 处理数据;采用 SPSS 了土壤氮含量的流失,其中 B(紫云英-早稻-玉米||甘
软件(version18.0,Chicago,Illinois,USA)对土壤理 薯)、C(油菜-甘蔗||春大豆)和 E(休耕)处理效果
化性质进行方差分析(ANOVA),Duncan’s 法进行 较好。
表2 不同轮作休耕模式下土壤理化性质
Table 2 Soil physicochemical properties
处理 AN/ AP/ AK/ TN/ SOM/ NH 4 -N/ NO 3 -N/ SBD/ SWC/
+
-
pH
Treatment (mg/kg) (mg/kg) (mg/kg) % (g/kg) (mg/kg) (mg/kg) (mg/kg) %
A(CK) 4.78c 177.01b 41.58c 31.33d 2.00a 33.08a 14.32a 8.80b 2.01a 32.08b
B 5.73b 189.63a 74.34ab 61.67bc 1.92b 30.92a 15.56a 36.75a 1.11b 20.99c
C 6.28a 187.33a 80.98a 76.00a 1.95b 26.80b 9.19b 33.14a 1.14b 23.08c
D 6.11a 189.43a 74.02ab 70.00ab 1.93b 31.86a 9.49b 28.85a 1.08b 4.81d
E 6.14a 188.55a 70.01b 52.33c 1.96ab 33.22a 9.45b 29.56a 1.06b 42.37a
注:数据为 3个重复的平均值,同列不同小写字母分别表示在 5% 水平的显著差异(P <0.05)。SOM:有机质,AP:有效磷,AK:速效钾,
-
+
AN:碱解氮,TN:全氮,NH 4 -N:铵态氮,NO 3 -N:硝态氮,SWC:土壤含水率,SBD:土壤容重。下同。Note:Data are the average of 3
replicates,and different lowercase letters in the same column represent significant differences at the 5% level(P <0.05). SOM:Soil organic
matter,AP:Soil available phosphorus,AK:Soil available potassium,AN:Soil alkaline hydrolyzable nitrogen,TN:Soil total nitrogen,
-
+
NH 4 -N:Soil ammonium nitrogen,NO 3 -N:Soil nitrate-nitrogen,SWC:soil water content,SBD:Soil bulk density. The same as follows.
2.2 不同轮作休耕模式下土壤反硝化潜势 (CK)处理最高,其次是 E 处理,C 处理最低。各处
由图 1 可见 ,各处理的土壤反硝化潜势中 A 理 分 别 低 于 A(CK)处 理 82.49%、93.23%、

