Page 61 - 《华农农业大学学报》2020年第3期

华 中 农 业 大 学 学 报 第 ３９ 卷
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2.4 差异表达基因的 GO 功能富集分析
采用 Gose q 方法对菌株 Ss１６ 和 Ss４７ 的差异基
因进行 GO 功能聚类分析, 结果显示: 在分子功能中
注释到的条目有 ４４１ 个, 其中, 肽酶活性、 GTP 酶活
性、 氧化还原酶活性等富集水平最高; 在生物过程中
注释到的条目有 ９８４ 个, 其中, 氧化还原过程富集水
平最高; 在细胞组分中注释到 ２３８ 个条目, 其中, 细
胞内、 细胞器和蛋白质复合物富集水平最高( 图 ３ ).
2.5 差异表达基因的 KEGG 代谢通路富集分析
将甘蔗鞭黑粉菌 Ss１６ 和 Ss４７ 菌株差异基因进
行 KEGGp athwa y s富集分析, 结果显示: 差异表达

基因被富集到蔗糖与淀粉代谢( starchandsucrose
metabolism )、 ABC 转 运 蛋 白 ( ABCtrans p orters )、

芳香化合 物 的 降 解 ( de g radationofaromaticcomＧ
p
p ounds )、 蛋白质在内质网的加工( roteinp rocessＧ
图 ２ 甘蔗鞭黑粉菌 Ss１６ 和 Ss４７
菌株差异表达基因火山图 in g inendo p lasmicreticulum )、 代谢途径( metabolic
Fi g ．２ Volcanop lotsofdifferentiall yex p ressed p athwa y s )、 嘌呤代谢( urinemetabolism ) 等差异基
p
g enesinisolatesSs１６andSs４７ofS．scitamineum 因富集显著通路( 图 ４ ).

１． 氧化还原过程; ２． 细胞酰胺分解代谢过程; ３． 糖异生; ４． 己糖的生物合成过程; ５． 单糖生物合成过程; ６． 细胞识别; ７． 授粉; ８． 花粉 Ｇ 雌蕊
相互作用; ９． 花粉识别; １０． 磷脂酰肌醇 ３Ｇ 激酶信号转导; １１． 磷脂酰肌醇 ３Ｇ 激酶信号转导的调控; １２． 磷脂酰肌醇 ３Ｇ 激酶信号转导的正调
控; １３． 磷脂酰肌醇介导的信号传导; １４． 肌醇脂质介导的信号传导; １５． 嘌呤核糖核苷补救; １６． 蛋白质复合物; １７． 剪接体复合体; １８． 高尔
基体膜; １９． 肌动蛋白细胞骨架; ２０． 核染色体; ２１． 真核翻译起始因子 ３ 复合体; ２２． 浓缩染色体外动粒; ２３． 细胞器; ２４． 核泛素连接酶复合
体; ２５． 后期促进复合物; ２６．CullinＧRING 泛素连接酶复合物; ２７． 高尔基体部分; ２８． 细胞内; ２９． 质膜; ３０． 泛素连接酶复合物; ３１． 氧化还原
酶活性, 作用于成对的供体上, 并结合或还原分子氧; ３２． 角鲨烯单加氧酶活性; ３３． 氧化还原酶活性, 作用于成对的供体上, 并结合或还原分
子氧, NAD ( P ) H 作为一个供体, 并结合一个氧原子; ３４． 单加氧酶活性; ３５． 血红素结合; ３６．GTP 酶活性; ３７． 四吡咯结合; ３８． 内肽酶抑制
剂活性; ３９． 内肽酶调节剂活性; ４０． 黄素腺嘌呤二核苷酸结合; ４１． 水解酶活性, 作用于糖基键; ４２． 铁离子结合; ４３．NAD 结合; ４４． 肽酶活
性, 作用 于 LＧ 氨 基 酸 肽; ４５．NAD 核 苷 酶 活 性. １．OxidationＧreductionp rocess ; ２．Cellularamidecatabolicp rocess ; ３．Gluconeo g enesis ;
＋
４．Hexosebios y ntheticp rocess ; ５．Monosaccharidebios y ntheticp rocess ; ６．Cellreco g nition ; ７．Pollination ; ８．PollenＧ p istilinteraction ; ９．RecＧ
o g nitionof p ollen ; １０．Phos p hatid y linositol３Ｇkinasesi g nalin g ; １１．Re g ulationofp hos p hatid y linositol３Ｇkinasesi g nalin g ; １２．Positivere g ulaＧ
tionof p hos p hatid y linositol３Ｇkinasesi g nalin g ; １３．Phos p hatid y linositolＧmediatedsi g nalin g ; １４．Inositolli p idＧmediatedsi g nalin g ; １５．PurineriＧ
bonucleosidesalva g e ; １６．Proteincom p lex ; １７．S p liceosomalcom p lex ; １８．Gol g imembrane ; １９．Actinc y toskeleton ; ２０．Nuclearchromosome ;
２１．Eukar y otictranslationinitiationfactor３com p lex ; ２２．Condensedchromosomeouterkinetochore ; ２３．Or g anelle ; ２４．Nuclearubi q uitinli g Ｇ
asecom p lex ; ２５．Ana p haseＧ p romotin gcom p lex ; ２６．CullinＧRING ubi q uitinli g asecom p lex ; ２７．Gol g ia pp aratusp art ; ２８．Intracellular ;
２９．Plasmamembrane ; ３０．Ubi q uitinli g asecom p lex ; ３１．Oxidoreductaseactivit y , actin gonp aireddonors , withincor p orationorreductionof
molecularox yg en ; ３２．S q ualenemonoox yg enaseactivit y ; ３３．Oxidoreductaseactivit y , actin gonp aireddonors , withincor p orateionorreducＧ
tionofmolecularox yg en , NAD ( P ) Hasonedonor , andincor p orationofoneatomofox yg en ; ３４．Monoox yg enaseactivit y ; ３５．HemebindＧ
in g ; ３６．GTPaseactivit y ; ３７．Tetra py rrolebindin g ; ３８．Endo p e p tidaseinhibitoractivit y ; ３９．Endo p e p tidasere g ulatoractivit y ; ４０．FlavinadeＧ
ninedinucleotidebindin g ; ４１．H y drolaseactivit y , actin g on g l y cos y lbonds ; ４２．Ironionbindin g ; ４３．NADbindin g ; ４４．Pe p tidaseactivit y , actＧ
＋
in gonLＧaminoacidp e p tides ; ４５．NAD nucleosidaseactivit y ．
图 ３ 甘蔗鞭黑粉菌 Ss１６ 和 Ss４７ 菌株差异表达基因 GO 分类注释
Fi g ．３ Geneontolo gy classificationoftheDEGsofisolatesSs１６andSs４７ofS．scitamineum