Page 40 - 《华中农业大学学报（自然科学版）》2024年第1期

34 华 中 农 业 大 学 学 报 第 43 卷

表 3 不同伴生处理主栽番茄植株根系内生细菌 Alpha 多样性指数
Table 3 Alpha diversity indexes of bacteria in root of tomatoes under different associated cultivations

栽培模式 香农指数 辛普森指数 Ace指数 Chao 1指数 覆盖率
Cultivation modes Shannon index Simpson index Ace index Chao 1 index Coverage
A 4.15±0.18a 0.07±0.035a 519.00±12.54a 521.23±27.45ab 0.99
B 4.22±0.18a 0.04±0.005b 481.14±29.08a 484.46±18.02ab 0.99
C 4.49±0.21a 0.03±0.010b 555.08±63.87a 554.22±34.11a 0.99
D 4.35±0.18a 0.04±0.003b 523.35±11.09a 515.29±26.25ab 0.99
E 4.19±0.16a 0.04±0.007b 470.79±59.38a 460.36±64.46b 0.99
F 4.41±0.13a 0.03±0.001b 543.75±67.06a 552.37±73.00a 0.99
为爬管菌属（Herpetosiphon），番茄伴生薄荷（E）特有
的优势内生细菌属为微杆菌属（Microbacterium）。
番茄单作（F）特有的优势内生细菌属包括芽孢杆菌
属（Bacillus）、栖大理石菌属（Marmoricola）和糖霉菌
属 （Glycomyces）。结果表明：与番茄单作相比，虽然
番茄伴生不同作物并没有提高主栽番茄植株根系内
生细菌属分类水平组成，但改变了主栽番茄根系内
生中优势细菌属分类水平的丰度占比。
2.2 伴生处理番茄植株根系内生真菌多样性
1）番茄根系内生真菌 OTUs 聚类分析。基于
97% 相似水平对样品序列不同分类水平进行聚类分
图 1 不同伴生处理主栽番茄植株根系内生细菌 析（表 4），发现 6 个处理番茄根系内生真菌群落可分
门分类水平群落相对分布 为 9 门、31 纲、71 目、127 科、216 属、301 种和 595 个
Fig. 1 Relative distribution of endophytic bacteria OTUs。
in roots of tomatoes at phylum level under 2）番茄根系内生真菌 Alpha 多样性。 由表 5 可
different associated cultivations
知，伴生不同作物主栽番茄植株根系内生真菌香农
根系优势内生细菌的群落组成，同时亦改变了根系 指数和辛普森指数与番茄单作之间并不存在显著差
优势内生细菌门类的丰度占比。 异；同时不同伴生处理之间亦不存在显著差异；此
4）番茄根系内生细菌属分类水平。番茄单作和不 外，表征根系内生真菌丰富度的 Ace 和 Chao 1 指数，
同伴生处理番茄植株根系检测出优势内生细菌属（相 除伴生薄荷（E）和生菜（A）处理外，其余不同伴生处
对丰度占比大于1%）33个（图2）。番茄和生菜（A）、苋 理与番茄单作（F）之间亦不存在显著差异。上述结
菜（B）、菜心（C）、葱（D）、薄荷（E）以及番茄单作（F）的 果表明：本研究中 5 种不同作物伴生番茄处理，同样
伴生处理下番茄植株根系优势内生细菌属分别有22、 无助于显著提高主栽番茄植株根系内生真菌的多样
20、22、19、23、23个。其中，番茄伴生与单作处理共有 性和丰富度。
丰度占比排名前 5的细菌属为：链霉菌属（Streptomy‑ 3）番茄根系内生真菌门分类水平。由图 3可知，
ces）、Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia 、 番茄单作处理植株根系优势内生真菌门类为：子囊
德沃斯氏菌属（Devosia）、类诺卡氏菌属（Nocardioi‑ 菌门（Ascomycota）、油壶菌门（Olpidiomycota）、担子
des）、马赛菌属（Massilia）。相较于番茄单作（F），慢 菌门（Basidiomycota）、unclassified_k_Fungi、球 囊 菌
生根瘤菌属 （Bradyrhizobium）、不黏柄菌属（Asticca‑ 门（Glomeromycota）和壶菌门（Chytridiomycota）。番
caulis）是番茄伴生处理 A 到 E 所有的优势内生细菌 茄伴生生菜（A）、苋菜（B）、菜心（C）、葱（D）、薄荷
属。番茄伴生生菜（A）特有的优势内生细菌属为新 （E）以及番茄单作（F）的优势内生真菌门类（丰度占
草 小 螺 菌 属 （Noviherbaspirillum），番 茄 伴 生 苋 菜 比大于 1%）数量分别为 3、4、5、4、4、5。其中主要区
（B）特有的优势内生细菌属为游动放线菌属 （Acti‑ 别在于缺少 unclassified_k_Fungi。这一结果表明：伴
noplanes）， 番茄伴生葱（D）特有的优势内生细菌属 生处理均减少了主栽番茄植株根系中未分类的优势